(四)超二级结构和结构域
近年来在研究蛋白质构象、功能和进化的变化时,发现在蛋白质二级结构和三级结构之间存在着两个过渡层次,即超二级结构和结构域。
1、超二级结构
多肽链内若干顺序上相邻的二级结构的构象单元在空间折叠中靠近,彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构的组合体。
超二级结构在结构层次上高于二级结构,但不具有功能。超二级结构的形式主要有:-螺旋组合( ); -折叠组合( );-螺旋-折叠组合( );;希腊钥匙结构
超二级结构类型:
2、结构域
多肽链在超二级结构的基础上进一步的盘绕折叠成紧密的近似球状的结构,在空中彼此分隔,相互独立,结构域之间通过共价的、松散的肽链相连(铰链区)。
对于有些较小的蛋白质分子,结构域和-三级结构是一个意思,即这些蛋白质分子是单结构域的。
具有三级结构的蛋白质分子,往往具有球形、椭球形的物理外形,称之为球蛋白。
球蛋白常常是生物体内具有一定生理功能的活性蛋白质。
例如:肌红蛋白(Mb);
核糖核酸酶;
细胞色素C;
2、稳定三级结构的作用力
氢键
疏水力(疏水作用力)
范氏引力(分子间的作用力)
离子键(盐键)
酯键
二硫键
Garrett & Grisham (1999) Biochemistry (2e)
三级结构中的氢键
二级结构氢键
三级结构氢键
a helix
b sheet
Garrett & Grisham (1999) Biochemistry (2e)
胰脏 trypsin inhibitor
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