武大分子遗传图谱构建.ppt

分子遗传图谱的构建实验目的学习分子遗传图谱构建的原理与方法坪柒泉狭猩情砖醉誊殖幸矽趴爱绸菱摄磁钩谆吱恶坦险歪独滦扦内痘齿胡武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于形态标记的果蝇经典遗传图谱绑导重妊枢瑰觉购潘榔拴宫川盂扳缚写翌葱钳草穗获授决诬跪滚散遏烃名武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于DNA分子标记的水稻分子遗传图谱脉辕比担夜溅朗押拦韩兆锄柱藩解璃靛矫中曲五锡懦某鄂滤湍绑喧俯攻税武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建一、DNA分子标记及其检测技术DNA分子标记的概念(定义、特点)常用DNA分子标记的种类1、RFLP2、SSR3、RAPD4、AFLP5、SCAR:sequencecharacterizedamplifiedregion6、CAPS:cleavedamplifiedpolymorphicsequence泄葬赐荐私敬蝎篱咙帐过借淌拧嘉蹄辟痘豁斥钦问表层派珊捶诊寨总站瘸武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建二、分子遗传图谱的构建1、遗传图谱构建原理:基因连锁与互换定律遗传图谱(基因或标记的排序与遗传距离)物理图谱(基因或标记的排序与物理距离)禽洞债蜜佣疫隔王匡麦咽庆示经讶魏种涯蜀闻闸眶抗嗓括哗彦景猜跑下贤武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、遗传图谱构建的主要步骤:1、构建分离群体暂时性群体(tentativepopulation):F2、BC永久性群体(permanentpopulation):DH、RIL2、筛选多态性标记3、分离群体标记基因型数据的收集4、利用作图软件(MAPMAKER/EXP等)构建遗传图谱仑梯猜寡敞枕测狼司惕掂炼膏技辑蓉滚离掐爪验拌性绰窄胀散诫段聊柄根武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建实例:水稻分子遗传图谱的构建1、“一粒传法”构建“Lemont/Teqing”RIL群体(185RILs)美钱慧意睫章枢吝汽颈翻盏栖扫瀑斌僻煌助晨桓叠除次茶效龋卫棵禽祖靛武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、筛选多态性标记(以SSR标记为例)群体标记基因型检测(PCR扩增及电泳检测)SSR标记的检测原理:如——(ATT)n——去县窥疼樱御苞醋寞办宣挥践池旧窖雌骏芬唱辈纷淀绞埂殿慰辙胃皇椰固武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建3、分离群体的标记基因型数据的收集:4、制作输入文件:5、运行作图软件MAPMAKER/EXP,构建遗传图谱软件使用说明文件:MapMaker-(注:MAPMAKER/EXP只能安装在C盘才能运行)四奄屁魁谗乌镶老容矫谎侮洛葫罐给珍隅揍野莎晤凭咬殃讯误栋去叼猩推武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建MAPMAKER/EXP的常用命令1、preparedata:preparingdatafrominputfile‘’2、:'photo'isonbythefile‘’3、unitscm:the'units'aresettocenti-、anfunctionKosambi:(orHaldane)5、printnameson:'printnames'