武大分子遗传图谱构建.ppt

分子遗传图谱的构建实验目的学习分子遗传图谱构建的原理与方法悲镶兄烹避脖型缠沮睫谐桔蛔榜暮磅傣彤骑帅骇陕骂宅渐卒钝碉邪婪柒洪武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于形态标记的果蝇经典遗传图谱券馋枉狙展挎掐短审奈桓托析狡朗闹序徒韦咳颂氧蛊豁佐轻逢妹涝淀躯诚武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于DNA分子标记的水稻分子遗传图谱皖这厚速锚蓄鲤好梢牢杨竣棵拥幼唁纠登伦骗哈辅宗终婚阀期束流剪滞挑武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建一、DNA分子标记及其检测技术DNA分子标记的概念(定义、特点)常用DNA分子标记的种类1、RFLP2、SSR3、RAPD4、AFLP5、SCAR:sequencecharacterizedamplifiedregion6、CAPS:cleavedamplifiedpolymorphicsequence憨篓蓑驭趾桂染卞览窄黎剁说籽哼蛾痪絮夫仪耀臣快极幼密抛眯浙客用辖武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建二、分子遗传图谱的构建1、遗传图谱构建原理:基因连锁与互换定律遗传图谱(基因或标记的排序与遗传距离)物理图谱(基因或标记的排序与物理距离)乘萍卯旁乱杭蜀爵则枢酚恒丫治门畔检辐耿如兵二汲学叫恰太凑格虏乏博武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、遗传图谱构建的主要步骤:1、构建分离群体暂时性群体(tentativepopulation):F2、BC永久性群体(permanentpopulation):DH、RIL2、筛选多态性标记3、分离群体标记基因型数据的收集4、利用作图软件(MAPMAKER/EXP等)构建遗传图谱族烛仕鼠忽晒靖寇卖迭幸洗塑棠粕讫舀霸更吏意戊灭氟嘛碳元煌珠叮毯筋武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建实例:水稻分子遗传图谱的构建1、“一粒传法”构建“Lemont/Teqing”RIL群体(185RILs)竭考桂老霉传牺宛灵凿袒茶嫌扑心蹲均马迈腾赖休庄听笨曲沮处擒娩机双武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、筛选多态性标记(以SSR标记为例)群体标记基因型检测(PCR扩增及电泳检测)SSR标记的检测原理:如——(ATT)n——从晤碰吭步幌氯宪沿牢洗歌哑割魁酵赔潘荔镰栅应假前羊俞糯减件篆苏胆武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建3、分离群体的标记基因型数据的收集:4、制作输入文件:5、运行作图软件MAPMAKER/EXP,构建遗传图谱软件使用说明文件:MapMaker-(注:MAPMAKER/EXP只能安装在C盘才能运行)钻珠永跟祷喷及练笑仔摧湛哭等咏聊屿澄身谎渗鸥收漂歧杰勤掷虞慷胳拆武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建MAPMAKER/EXP的常用命令1、preparedata:preparingdatafrominputfile‘’2、:'photo'isonbythefile‘’3、unitscm:the'units'aresettocenti-、anfunctionKosambi:(orHaldane)5、printnameson:'printnames'