MEGA软件——系统发育树构建方法(图文讲解)12月02日⁄Evolution⁄字号小中大⁄评论3条⁄阅读3,872次[点击加入在线收藏夹]一、序列文本的准备构树之前先将目标基因序列都分别保存为txt文本文件中(或者把所有序列保存在同一个txt文本中,可以用“>基因名称”作为第一行,然后重起一行编辑基因序列),序列只包含序列字母(ATCG或氨基酸简写字母)。文件名名称可以已经您的想法随意编辑。二、序列导入到Mega5软件(1)打开Mega5软件,界面如下(2)导入需要构建系统发育树的目的序列OK选择分析序列类型(如果是DNA序列,点击DNA,如果是蛋白序列,点击Protein)出现新的对话框,创建新的数据文件选择序列类型导入序列导入序列成功。(3)序列比对分析点击工具栏中“W”工具,进行比对分析,比对结束后删除两端不可以完全对齐碱基(4)系统发育分析关闭窗口,选择保存文件路径,自定义文件名称三、系统发育树构建根据不同分析目的,选择相应的分析算法,本例子以N—J算法为例Bootstrap选择1000,pute,开始计算计算完毕后,生成系统发育树。
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