序列提交软件sequin使用方法.doc

1. 填写作者、联系方式等，可以将这一部分存为模板，以后修改时可以省去大量时间。
2. 选择序列准备方法”use the normal submission dialog”
3. 选择序列格式
Submission type：single sequence（单条序列）
Batch submission（批量提交，适用于相似的多条序列）
4. 载入DNA序列：
将DNA 序列保存为FASTA格式（注意序列不要有“—”，尤其是多条序列时，较短的序列末端可能会用“—”补齐，可以用记事本打开文件，删除）。 序列名称不要超过32个字符，可以用简单的编号。
5. 选择测序、拼接方法
6. 添加物种名称
7. 补充蛋白信息（如果序列是编码序列，则要提交蛋白序列信息）若为ITS序列见后
用MEGA或BioEdit将DNA序列翻译成蛋白序列，如果有含子，则先要找出含子并切除，否则不能翻译成功。（确定含子位置方法：先从GenBank上下载一条该基因已经提交并注释好的序列，跟自己的序列比对一下，然后根据下载序列的注释确定自己序列的含子位置）
8. 注释
9. 添加分类地位
10. mRNA 添加“Name = 基因全称” CDS添加“product = 基因全称”
11. 更改序列标题（编号）；Source 添加“strain = ”：
Modifiers > organism
12. 保存
若点击Done之后可以保存，则说明序列修改成功，可以提交了；若有错误则会提示，修改好之后再保存。
ITS序列
7. 以下信息无需填写
8.
9. 此时进入预览页面会有错误提示，可以忽略。
10. 添加miscRNA
11.