家重大科学研究计划课题任务书.doc

家重大科学研究计划课题任务书.doc家重大科学研究计划
课题任务书
项目名称：蛋白质定量新方法及相关技术研究
课题编号：2012CB910602
课题名称：基于色谱-质谱的蛋白质组相对定量新方法和
新技术
中华人民共和国科学技术部制
二O 年九月
—、研究内容
针对规模化蛋白质相对定量中标记反应效率低、非标记方法重复性差以及 定量软件效能低等科学问题，本课题拟开展三个方面的研究，提高相对定量方法 的精确度、准确度以及覆盖率。
K标记相对定量新方法和新技术
标记定量方法采用不同“轻'‘质和“重'，质同位素标记的、化学性质基本相似 的、成对出现的多肽质谱峰信号强度作为定量的依据，但目前仍局限于中高丰度 蛋白质的定量，且同位素标记试剂价格较为昂贵。研究特色：从研究新型标记定 量方法、不同标记定量方法的组合和新型标记试剂入手，开发基于标记技术的蛋 白质相对定量新方法和新技术。
2、 非标记相对定量新方法和新技术
非标记定量是不进行事先的标记而直接利用蛋白质鉴定中产生的数据进行定 量的过程，可以避免标记定量过程复杂和试剂昂贵等缺点。但非标记定量法在离 子抑制效应、色谱■质谱的稳定性和重复性等方面的问题都还有待改进。研究特 色：从添加内标、加入色谱信息、发展高稳定离子化技术等方面入手，开发基于 非标记技术的蛋白质定量新方法和新技术。
关键计算问题研究与软件系统开发
新型标记方法将面临新的定量数据处理的挑战，需要编译相应的定量软件; 自动化的同位素标记/非标定量技术可以在一次实验中产生成千上万的质谱数 据。研究特色：从高阶数据处理技术、特征图谱识别、新型标记/非标记定量策 略所需算法入手，开展关键计算问题研究和开发软件系统。
二、预期目标
根据课题研究内容所包括的标记定量方法、非标记