GS FLX的技术.doc

高通量基因组测序系统 GS FLX 的技术原理许冠东* (罗氏应用科学部罗氏诊断产品有限公司上海 200031 ) 摘要: 焦磷酸法最早是应用在检测 DNA 甲基化和 SNP 位点分析的一项技术,在 200 5 年底, 此技术被用来进行基因组序列的测定, 已经成为下一代高通量测序中最成熟的一种技术。本篇文章着重介绍了采用焦磷酸测序法的罗氏公司最新一代高通量基因组测序系统 GS FLX 的技术原理, 操作过程和广泛的应用范围。关键词: GS FLX, 焦磷酸测序, 高通量, 读长, 应用 GS FLX, the Leader in Next Generation Sequencer XU Guan-Dong* ( Roche Applied Science, Roche Diagnostics (Shanghai) Limited, Shanghai 200031 ) Abstract: Pyrosequencing technology is famous for its application in detection of SNP site and DNA me-thylation. At the end of 2005, pyrosequencing technology was used to sequence the whole genome and it has e the most developed next generation high-throughput sequencing technonlogy. In this article, we in-troduce the theory, operation process and wide application field of the second generation genome sequencer FLX system provided by Roche Keywords: GS FLX, Pyrosequencing, High throughput, Read length, Application 2007 年9月 28日, 在《 Science 》国际顶级学术期刊的网站上, 同时查询到 3 篇突破性的基础研究成果[1~3] 。这3 篇文章的研究对象和领域完全不同, 分别涉及了对人类基因组变异的研究, 蜜蜂社会性的进化讨论以及灭绝的古生物线粒体全序列的测定。然而它们的共同点是, 它们所使用的分析数据和实验结果都来自罗氏 454 公司研发的高通量测序技术平 Genome SequencerTM 。在 1 周的时间里就有 3篇 GS 系统在不同研究领域的应用文章发表在《 Science 》上, 累计已有近 100 篇 Genome SequencerTM 的应用成果发表在世界知名期刊上,说明 454 测序技术和 GS 系统在生命科学研究领域的广泛适用性。 Genome Sequencer FLX (GS FLX) 系统是罗氏 454 公司的第二代测序平台, GS FL X 的命名正是来源于其多领域的灵活(flexible) 应用。 GS FLX 系统在技术原理和性能方面的表现优越, 每个反应可以得到超过 40 万个序列读长, 单个序列的读长可达 300bp , 一个