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The R Project for Statistical Computing
R是一种统计绘图语言,也指实现该语言The Comprehensive R Archive Network
简称CRAN,由世界几十个镜像网站组成网络,提供下载安装程序和相应软件包。各镜像更新频率一般为1-2夭。
. R程序包(R Packages)
程序包是什么?
R程序包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。Window下的R程序包是经过编译的zip包。每个程序包包含R数、数据、帮助文件、描述文件等。
为什么要安装程序包?
R程序包是R功能扩展,特定的分析功能,需要用相应的程序包实现。
例如:系统发育分析,常用到ape程序包,群落生态学Began包等。
包的基本信息
在CRAN提供了每个包的源代码和编译好的程序包,以vegan包为例,CRAN提供了:
Package source:
MacOS X binary:
Windows binary:
Reference manual:
Window下程序包为zip文件,安装时不要解压缩。
安装程序包的方法
()
如果已经连接到互联网,在括号中输入要安装的程序包名称,选择镜像后,程序将自动下载并安装程序包。
例如:要安装picante包,在控制台中输入
(“picante”)
2安装本地zip包
路径:Packages->install packages from local files
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选择本地磁盘上存储zip包的文件夹。
程序包使用
程序包中的函数,都要先导入,再使用,因此导入程序包是第一步。在控制台中输入如下命令:
1ibrary(vegan)
library(ade4)
程序包内的函数的用法与R内置的基本函数用法一样。
library(vegan)
This is vegan
查看程序包帮助文件
vegan程序包内部都有哪些函数?分别有什么功能?
查询程序包内容最常用的方法:
1 菜单帮助->Html帮助
2 查看pdf帮助文档
程序包的卸载
(“packages name”)来实现
. 查看函数的帮助文件
函数的默认值是什么?怎么使用?使用时需要注意什么问题?需要查询函数的帮助。
1 ? ??”…”(根据关键词寻找帮助)
2 RGui->Help->Html help
3 apropos(””)或者??
4 help(” ”)
5 (” ”)
6 查看R包pdf手册
帮助文件的内容
lm{stats} #函数名及所在包
Fitting Linear
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