关于蛋白质的结构PPT
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按分子形状分
按组成分
按溶解度分(见P158表4-1)
只含由-氨基酸组成的肽链,不含其它成分
球状蛋白质
纤维状蛋白质
蛋白质分类
二)二面角( 参看P204 )
-碳是两个相邻酰胺平面的连接点,绕Cα-N键轴旋转的二面角(C-N-Cα-C)称为Φ,绕Cα-C键轴旋转的二面角(N-Cα-C-N)称为Ψ。
当Φ或Ψ旋转键所在酰胺平面的取向二等分H- Cα-R(侧链)平面,且该旋转键两侧的主链处于顺式构型时,规定Φ=0º ,Ψ=0º。
原则上Φ和Ψ可以取-180º--+180º之间的任一值。当Φ=180º ,Ψ=180º时, Cα的两个相邻肽单位将呈现充分伸展的肽链构象。
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Phi=0, psi=0
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肽键C-N的部分双键性质其键长小于胺中的C-N
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从Cα沿键轴方向观察
顺时针旋转的Φ和Ψ角度为正值(+)
逆时针旋转的为负值(—)
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不可能的空间构象
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(三)肽的性质
肽的化学反应与氨基酸一样,游离的 α-氨基﹑α-羧基﹑R基团可发生与氨基酸中相应基团类似的反应;
含有两个以上肽键的化合物在碱性溶液中与Cu2+生成紫红色到蓝紫色的络合物,称为双缩脲反应,可以测定多肽和蛋白质含量。
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在生物体中,多肽最重要的存在形式是作为 蛋白质的亚单位。
但是,也有许多分子量比较小的多肽以游离 状态存在。这类多肽通常都具有特殊的生理功能,常称为活性肽。
如:脑啡肽;激素类多肽;抗生素类多肽; 谷胱甘肽;蛇毒多肽等。
(四)重要的天然多肽
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+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO- +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO-
Met-脑啡肽 Leu-脑啡肽
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谷胱甘肽
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包括:
(1)组成蛋白质的多肽链数目。
(2)多肽链的氨基酸顺序,
(3)多肽链内或链间二硫键的数目和位置。
其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。
三、 蛋白质分子结构
(一)蛋白质的一级结构(Primary structure)
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蛋白质的一级结构
链内二硫键
链间二硫键
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蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。,现在已经有上千种不同蛋白质的一级结构被测定。
测定步骤:
①多肽链的拆分:由多条多肽链组成的蛋白质分子,必须先进行拆分。几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为寡聚蛋白质,如,血红蛋白为四聚体,烯醇化酶为二聚体;可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即可分开多肽链(亚基)。
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②测定蛋白质分子中多肽链的数目:通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系,即可确定多肽链的数目。
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③二硫键的断裂:几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用过量的-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。可以通过加入盐酸胍方法解离多肽链之间的非共价力;应用过甲酸氧化法或巯基还原法拆分多肽链间的二硫键。
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④测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比;
⑤分析多肽链的N-末端和C-末端
末端氨基酸的测定:多肽链端基氨基酸分为两类,N-端氨基酸和C-端氨基酸。在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。
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末端氨基酸测定的主要方法有:
A. 二硝基氟苯(DNFB)法
B. 丹磺酰氯法:在碱性条件下,丹磺酰氯(二甲氨基萘磺酰氯)可以与N-端氨基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰-氨基酸。此法的优点是丹磺酰-氨基酸有很强的荧光性质,检测灵敏度可以达到110-9mol。
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Edman 降解法
苯异硫氰酸
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