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一石一松
对于 cf DNA 可能大家知道的并不多,至于癌症和产检,大家肯定就比较熟
悉了。而 cf DNA 在癌症早期诊断与后期评价癌症药物疗效还有孕妇无创产前基
因检测中起着非常重要的作用。这里大家就有疑问了,为什么 cf DNA 有这么大
的作用,到底什么是 cf DNA 呢?小编为大家细细道来。
cf DNA 是 cell free DNA 的缩写,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。
大家又会问了,DNA 不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢,除非细胞破了
(裂解了)细胞内的 DNA 才会被释放到出来?没错,这正是 cf DNA 的来源,
从这一点去思考 cf DNA 的产生就比较简单了。目前发现 Cell-free DNA 的来源
主要有两种:一是细胞主种 动裂解(又叫细胞凋亡)过程中产生的 “DNA ladder”
式的片段化核酸(图 1),它们的大小基本上在 150-200bp 左右。关于细胞凋亡这
点小编跟大家稍微解释一下,人体是一个庞大而复杂的循环系统,其中的运作周
而复始,循环往复。除了整个人体的大循环,还有组成人体的各个部件各自的“小
循环”,简单来说,就是人体各个器官更换状态的周期。一般情况下 ,人体会在
半年内更新掉身体的 98%组织的细胞,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地
有细胞在凋亡又有新的细胞在形成。另一就是细胞被种 动裂解 ——这裂解的种 方
式就有很多,既可以来源于外界物理或者化学刺激引发的组织坏死, 也可以是自
身免疫系统对细胞杀伤作用,不同的是这个过程产生的核酸很大,会接近基因组
DNA 大小。当然,无论是哪一种方式产生的 cf DNA,都会进一步在外周血中被
快速清除,同时体内的细胞裂解又会释放新的 cf DNA,这个动态的过程会使得
体内的 cf DNA 维持在一个相对稳定的较低的水平。总结前面几点可以知道:cf
DNA 实际上是机体内细胞损伤的产物,它可以来自细胞凋亡,还可以来自细胞
被动裂解。我们可以认为人体内可检测到的 cf DNA 含量,实际上反映的是 DNA
的释放和清除两方面因素平衡后的情况。对于健康的人来说,血液中的 cf DNA
主要来源是体细胞正常的新陈代谢,因此应该维持在一个较低的水平。当有很严
重的系统性器官损伤打破这种平衡时,大量死亡的细胞会产生大量的 cfDNA,
使得血液中的 cf DNA 含量大大增加。因此,反过来就有可能通过 cfDNA 的含
量变化,来对这类型疾病进行一个评估。目前已经有很多文献,证实在包括系统
性红斑狼疮在内的风湿性关节炎,肾小球肾炎,胰腺炎,炎症性肠病、肝炎等炎
症疾病患者血浆中,都能够显著性地检测到 cfDNA 相比健康人群含量大大增加。

图 1:cf DNA 是由身体内正常细胞凋亡释放出来
说到 cf DNA 与肿瘤的关系,这里我们得知道另外两个词 ct DNA(Circulating
tumor DNA)翻译为循环肿瘤 DNA 和 CTCs 即循环肿瘤细胞(circulating tumor
cells)。Ct DNA 为来源肿瘤细胞的 cf DNA,也就是说其实 ct DNA 只是 cf DNA
中的一种。到目前为止,ctDNA 可以作为肿瘤预后的标志物,而且也能够用来
预测药物治疗的效果。再解释一下无创产检与 cf DNA 的关系,因为在孕妇血液
中,约有 10%-15%的 cfDNA 来自于胎盘滋养层,这意味着可以通过母亲外周血
测序分析其中的 cf DNA 信息有一部分是胎儿的,而通过这一部分就可以判断胎
儿是否存在整个染色体或者大片段 DNA 的变异,这比起以前的方式是要安全可
靠得多。

图 2:cf DNA、CTCs 和 ct DNA
cf DNA 在肿瘤生物学中如此出名,但是它的最早发现却不是在肿瘤患者的
血样中,而是于 1948 年由法国科学家 Mendel 和 Metais 在健康人的血清和血浆
中通过高氯酸沉淀的方法发现 cf DNA(图 3)。由于当时人们都还没有意识到
DNA 是遗传物质,因此并没有充分地引起大家重视。在 1977 年人们第一次发现
肿瘤病人血清中的 cf DNA 含量比健康人要高,但当时并无法知道这些 DNA 是
否来自于肿瘤细胞还是正常组织。直到 1989 年,人们才通过 DNA 链的热力学
稳定性比较,第一次确定在肿瘤患者血浆中发现的 DNA 有一部分是来自于肿瘤
细胞的,并且在这个时候提出了“液体活检”的概念。从这之后 cf DNA 每一次
的重大发现都与肿瘤密不可分,这也使得 cf DNA 研究有了长足的进步,并且很
快体现了其研究价值所在。

图 3:cf DNA 发现的时间轴
当然,我们现在对 cf DNA 的了解也只是皮毛,其中包含的各种序列信息
还有待于我们进一步细细发掘。
[1] Fariz Nurwidya ,etal. Circulating tumor cell and cell-free circulating tumor DNA in lung
cancer. CMJ 2016
[2] Giulia Siravegna and Alberto Bardelli. Genotyping cell-free tumor DNA in the blood to detect
residual disease and drug resistance. Genome Biology 2014

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  • 时间2023-05-14
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