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华癸中慢生根瘤菌染色体基因组序列的初步分析及共生固氮相关功能基因研究.pdf


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华癸中慢生根瘤菌染色体基因组序列的初步分析及共生固氮相关功能基因研究氨基酸水平的同源性,绘制了共线性关系点阵图。结果显示:其中有��鰂���中的基因数大于�个。最大的一个���包含了��龌�颍�粲贛������肱������、具有鲜明特色和研在全基因组编码基因预测中,运用针对细菌基因组的预测软件����快速获得了氨基酸序列,用于后续的基因功能注释进化等分析。进一步用基因预测结果提取出的蛋白质文件与各个数据库进行了���榷裕坏饔肅�库中分类文件对��榷越峁��辛朔掷啵坏饔肒��庵蟹掷辔募�癿�文件夹对��序列背后的生物学意义。结果显示:预测所得������觯珻�����长度������������ァ:���鰐����鰎��M�庇媒��物种����������,对基因家族进行了分析,根据�/�推测了快速进化基因,目前只针对单拷贝的基因家族进行了分析。还通过比较上述两个基因组�������李友国‘王善明彭杰丽刘流马斌广谢福莉陈大松李一星�┮滴⑸�镅Ч�抑氐闶笛槭一V信┮荡笱�浜����究优势的一种共生固氮资源。由于它的宿主范围狭窄,仅能与紫云英属的少数种类共生,互作结果形成不定型根瘤,具有严格的专一性,还可与菌根真菌互作形成菌根共生体。因此它在根瘤菌功能基因组、共生固氮及菌植互作分子机理等研究中占有非常重要的地位。我们课题组开展了华癸中慢生根瘤菌����蜃�的测序和分析,目前其染色体基因组序列精细图组装与分析基本完成。基于比较基因组和功能基因组学途径,正开展其有关共生结瘤、类菌体分化发育、固氮和互作方面的分析和研究。比对结果进行了分类和画代谢图;获得了大部分基因功能信息,有待进一步挖掘����������.��的基因和����甑�全部基因构建��菌株的有��觯�粲谖颐撬����菌株的有��觥4未蟮膄������������������:�������甴��甧�.�������.��������������������.
极端嗜酸微生物������������基因组:环境适应及其潜在应用海洋石油降解菌的基因组分析与烃类降解机制研究进一步对华癸中慢生根瘤菌���斡隤�代谢、��虴�等细胞表育及�糠�结瘤固氮等过程有关的功能基因��进行了初步解析。并对其中���,专性自养细菌,可以通过氧化元素硫以及还原性硫化合物作为唯一能源生长。通过基因组学的分析,发现其采用多种策略来应对生物冶金过程中高浓度重金属离子、寡营养碳源、低�等环境及其变化,从而使得其在冶金工业中发挥重要

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  • 时间2015-06-29