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生物信息论文.doc


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《生物信息学》课程论文题目:应用生物信息学方法对未知序列R-2的性质和结构分析综述院(系),以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。,利用生物信息学数据库和相关软件进行处理分析,内容包括其可能表达蛋白质的理化性质,所属蛋白质家族类型,蛋白质二级结构,亲疏水性及结构域的初步分析。-2未知序列的开放阅读框(ORF)的位置、编码氨基酸个数。下图为基本操作流程:原始序列Goodies-pleteDNAORFSearch-findORFGoodies--2未知序列翻译的蛋白的分子量及等电点。网址ls/。,分析N端信号肽的切点位置,并判断是否为分泌蛋白。网址为/services/SignalP/。-2未知序列翻译的蛋白的同源序列。并选择感兴趣的若干序列用于同源比对。-2未知序列翻译的蛋白的结构包括:α螺旋、β折叠、无规卷曲及转角。应用expasy的protscale预测R-2未知序列翻译的蛋白的亲水区及疏水区分布。网址为http://web./tmp/-2未知序列翻译的蛋白质的结构功能域。网址为-、(R-2序列),通过DNAstar查找开放阅读框,并翻译成蛋白质。该基因cDNA全长1578bp,其中开放阅读框为1281bp,位置是从21-1301,共编码426个氨基酸。找到开放阅读框如下:。,氨基酸数为426,。>40,证明这类蛋白不稳定。,说明该蛋白疏水。氨基酸数:426分子量::(ASP+谷氨酸):30总数量的正电荷残基(Arg+赖氨酸):30原子组成:CarbonC 2128HydrogenH 3316NitrogenN 566OxygenO 632SulfurS 15分子式:C2128H3316N566O632S15原子总数:6657消光系数:ExtinctioncoefficientsareinunitsofM-1cm-1,

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  • 时间2019-04-01
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