“R语言在生态学和生物多样性研究中的应用”专题基于的群落多元统计分析——用vegan包进行排序分析赖江山(janson)******@,是群落分析的package作者:JariOksanen--/web/packages/vegan/:///~jarioksa/softhelp/>library(vegan)什么是排序(ordination)?排序的过程是将样方或植物种排列在一定的空间,使得排序轴能够反映一定的生态梯度,从而能够解释植被或植物种的分布与环境因子间的关系,也就是说排序是为了揭示植被-环境间的生态关系。因此,排序也叫梯度分析(gradientanalysis)。间接梯度分析(Indirectgradientanalysis)直接梯度分析(directgradientanalysis)2个种的排序图3个种的排序图4个种的排序图???40个种排序图???排序的目标:,减少坐标轴的数目;,即发生最小的畸变,也就是让新的坐标系前几轴排序轴包含大量的生态信息。排序类别(inCANOCO)间接梯度分析(IndirectGradientAnalysis):PCA(ponentsanalysis)CA(Correspondenceanalysis)DCA(DetrendedCorrespondenceAnalysis)直接梯度分析(DirectGradientAnalysis):RDA(A(Canonicalcorrespondenceanalysis)DCCA(A)A群落数据输入>gtsdata=("",header=T)>gtsdata>dim(gtsdata)环境因子数据输入>gtsenv=("",header=T);>gtsenv>dim(gtsenv)
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