生信编程直播课程优秀学员学习心得及作业展示3.doc

生信编程直播课程优秀学员学习心得及作业展示3 大家好,本次分享一下我在做生信技能树———生信编程直播第一题和第二题的一些方法和体会,最后附上自己学习之后的代码成果学习感悟首先说明一下,我不算是完全从0开始学习,因为生物的知识和python的语言之前都知道一点,但说实话,我的python距离真正的实践还差的很远,也没有常用所以基本忘完真的很感谢群主和老师们搭建这样一个学台,并且讲解的内容会涉及到方方面面,从数据的下载讲解到编程的技巧思维,还有生物的知识等等所以如果你是刚开始学习,不用担心,当你做了1-2道题之后,你就会发现在老师们的引导下,你可以很快的入门如果你对于编程是完全的新手,不用担心,所有的老师都会告诉你如果遇到不懂的,直接先去网上搜索一下例如还没有装python,你可以直接去网上搜索一下“python下载”就可以下载安装python,如果你是跟着老师学习,老师同样给你推荐很好的一些编辑器使用如果遇到不懂的命令或者错误提示信息,大部分同样可以在网上找到答案或者在论坛跟别人讨论当然如果你刚开始接触python,我会建议你先学习一些python的基本命令和语法,因为老师们不会讲解最基础的语法,还有你要使用一些非python自带的包,就要学会安装,pip基本可以搞定你在刚开始学习的时候会发现很多不理解的地方,我的建议是先尝试去运行老师演示的代码,看看会发生什么,这样你就会慢慢的有了对编程的理解关于题目下面说说和题目相关的内容,前两道题其实有些类似,我会从我的做题思路出发串讲一下更详细的内容,大家可以去到我们的网站查看,有详细的问题解析和大家的做题情况及讨论地址:http:/// 对于每道题,我一般会在看老师视频之前尝试自己做一遍,即使做的不对甚至做不出来,那么在看老师视频的时候就可以看到差距从而可以查漏补缺第一道题是探究人类外显子区域的长度,第二道题是hg19基因组序列的探究我跟东野老师学到了一个习惯:面对一个问题不是马上就去写代码,而是要先把问题解析清楚,例如数据类型、问题说明,数据结构等分析出来,老手们的思路可能很快就把这些想清楚,但是新手最好还是先把这些想清楚,养成好习惯这两道题首先涉及到数据下载,感谢群主已经在问题描述里把链接都给出来了,节省我们学员的时间接下来你需要了解你下载下来的数据结构以及你需要提取的数据信息,例如第一题需要的就是外显子的起始点和终止点着两列然后是你想统计的结果和你要储存的数据结构,例如第一题就是把每个exon的起始到终止存在字典里,把它的长度累加起来最后就是输出结果了,可以直接打印在屏幕或者输入到一个文件里前面我提到了每次我都会先自己做一次,然后看老师视频,这样就会学到新知识并且比较深刻,例如第一题我自己做的时候就没有考虑外显子的重复,对每个外显子都统计了,最后跟老师答案比较就发现自己没有去除那些完全重复的外显子,另外对比代码也可以学到新的包和高级快速的技巧最后提醒大家,一定要对自己的代码写上清楚的注释信息,这样以后自己再看或者跟别人交流就会很清楚,这一点我之前做的不太好也没重视,现在很多时候就要重新理解浪费时间这里讲解了我的一些思路和体会,论坛有更多人的分享需要你们去学习探索做了这两道题之后,再写代码的时候你会发现自己多了很多技巧,例如你的代码结构会更成熟,思维更清晰了,包