蛋白质化-结构与功能.ppt

蛋白质分子结构蛋白质的分子结构包括一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)高级结构一、蛋白质的一级结构:定义:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键位置特点:基础结构,稳定结构牛胰岛素的一级结构(局部):牛胰岛素由A、B两条肽链组成,A链20个氨基酸残基,B链30个氨基酸残基二、蛋白质的空间结构:定义:通常称蛋白质的构象,或高级结构,是指蛋白质分子中所有原子在三维空间的分布和肽链的走向(一)二级结构:(1)概念:二级结构定义—指多肽主链有一定周期性的,由氢键维持的局部空间结构。由于单键可以自由旋转,所以从理论上说肽链有无数种构象,但实际上,蛋白质的二级结构只有少数几种。SSH-Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-……AH-Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-……BSS肽单元肽平面(peptideunit,肽单元):由肽键中的四个原子和与之相邻的两个碳原子共同构成的刚性平面。(CαCONHCα)蛋白质二级结构的主要形式-螺旋(-helix)-折叠(-pleatedsheet)-转角(-turn)无规卷曲(randomcoil)特征:1、,;2、每个氨基酸残基的>N-H与前面第四个氨基酸残基的>C=0形成氢键,肽链上所有的肽键都参与氢键的形成。氢键形成为n+3。α-螺旋(α-helix)-折叠-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩折叠构象。①在-折叠中,-碳原子总是处于折叠的角上,氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直,.②-折叠结构的氢键主要是由两条肽链之间形成的;也可以在同一肽链的不同部分之间形成。几乎所有肽键都参与链内氢键的交联,氢键与链的长轴接近垂直。③-折叠有两种类型。一种为平行式,即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式,即相邻两条肽链的方向相反。平行b-折叠反平行b-折叠反平行b-折叠平行b-折叠-折叠有平行和反平行两种β-转角(β-turn)特征:多肽链中氨基酸残基n的羰基上的氧与残基(n+3)的氮原上的氢之间形成氢键,肽键回折1800。无规则卷曲示意图无规则卷曲细胞色素C的三级结构蛋白质分子中那些没有确定规律性的部分肽链构象称为无规卷曲。