郜刚生物信息学生物信息学的引论.ppt

1生物信息学引论GàoGāngIntroductiontoBioinformatics物质能量信息生命活动三要素:北京华大基因研究中心生物信息学平台主要从事数据处理、软件开发、数据库建立与维护、项目研发、大型机管理、系统与网络维护等方面工作。其中数据处理和项目研发以计算机为工具,结合生物、数学、物理等多学科知识,对测序产生的原始数据进行处理和分析,获得传统生物学实验工作无法得到的结果。,DirectorofHGPatNIH生物信息学(Bioinformatics)的来源(林华安)1987年提出“Bio-informatique”→“Bioinformatics”1955年出生于马来西亚。联合国Bioinformatics专家,UniversityofTexasatDallas分子与细胞生物学AdjunctProfessor、中国科学院基因遗传研究所客座教授。1981年英国伦敦大学帝国学院(ImperialCollege,LondonUniversity)毕业,1986年获得美国RochesterUniversity生化物理学博士学位,30岁取得佛罗里达州立大学终生教授。1992年受聘担任美国国家癌症中心及美国国家科学基金会审核委员。1995年后,历任多家生物科技公司生化信息执行长、副总裁等高层管理职位。1997年,创立结合软件与数据分析的专业顾问公司D’Trends,服务生物技术、制药及卫生保健等机构。林华安最近又将Biothechnology、Information结合纳米科技(Nano),提出Binformatics(生纳信息学)。生物信息学之父——,物理和化学的发展使我们可以清楚地认识物质的组成,从分子、原子、电子等各层次上深入地了解微观世界,而天文技术、空间技术的发展则使得我们可以了解地球以外的客观世界,以电子信息技术为龙头的工业技术的飞速发展,使得我们可以不断地改造世界,甚至为人类更加舒适地生活创造新的世界。生命科学在20世纪同样也得到了发展,生理学、细胞生物学、分子生物学等学科的发展使我们从器官、组织、细胞、生物大分子等各个层次认识了生命的物质基础。生物与其他物质有本质的区别,生物并非只是物质的简单堆积,生物体的生长发育是生命信息控制之下的复杂而有序的过程。目前,我们对生命的奥秘还不甚了解,对生命信息的组织、传递和表达还知之甚少。既然这牵涉到信息的组织、传递和表达,我们就可以用信息科学的方法和技术来尝试认识和分析生命信息。生物信息学(Bioinformatics)这个名词有许多不同的定义。从字面上来看,生物信息学是将信息科学和技术应用于生物学。生物信息学广义的概念是指应用信息科学的方法和技术,研究生物体系和生物过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递,研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息,或者也可以说成是生命科学中的信息科学。生物信息学狭义的概念是指应用信息科学的理论、方法和技术,管理、分析和利用生物分子数据。通过收集、组织、管理生物分子数据,使研究人员能够迅速地获得和方便地使用相关信息;通过处理、分析、挖掘生物分子数据,得到深层次的生物学知识,加深对生物世界的认识;在生物学、医学的研究和应用中,利用生物分子数据及其分析结果,可以大大提高研究和开发的科学性及效率,如根据基因功能分析结果来检测与疾病相关的基因,根据蛋白质分析结果进行新药设计。一般提到的"生物信息学"是就指这个狭义的概念,更准确地说,应该是分子生物信息学(MolecularBioinformatics)。信息科学molecularbioinformatics生物体系和过程中信息的存储、传递和表达细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中各种生物信息分子生物学数据深层次生物信息知识获取挖掘生命科学中的信息科学广义概念狭义概念