琼脂糖凝胶电泳检测DNA
丁新伦
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【一】背景知识
凝胶电泳是分离和纯化DNA片段最常用的技术;
分离、鉴定和提纯核酸首选的标准方法。
根据制备凝胶的材料:
琼脂糖电泳
凝胶
电泳 聚丙烯酰胺电泳
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【二】实验目的
学习琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法
检测碱裂解法提取质粒的结果
检测双酶切法鉴定重组质粒的结果
检测PCR法鉴定重组质粒的结果
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【三】实验原理
(1)某物质在电场作用下的迁移速度叫做电泳的速率,电泳的速率与核酸分子大小和构型有关。
DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。分子质量越小跑得越快,紧密构型快于松散型开环分子或线性分子,从而可以分离大小不同的DNA或RNA分子。
(2)琼脂糖是一种线性多糖聚合物,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。
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琼脂糖浓度(%)
线型DNA分子的分离范围(Kb)
5~60
1~20
~10
~7
~6
~3
~2
配制多大浓度的琼脂糖凝胶,要根据被检的DNA
分子大小来确定。
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(3)溴化乙锭为扁平状分子,在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分子形成EB-DNA复合物,其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可判断DNA分子量大小和粗略估计样品DNA浓度。
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琼脂糖是一种线性多糖聚合物。
浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。
琼脂糖浓度(%)
线型DNA分子的分离范围(Kb)
5~60
1~20
~10
~7
~6
~3
~2
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【四】仪器、材料与试剂
质粒样品、酶切样品和PCR样品。
凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。
琼脂糖、 1XTBE电泳缓冲液、溴化乙锭、 6X载样缓冲液 ( 6X loading buffer)和DNA分子量标准( Lambda DNA / EcoRI + HindIII Marker )等。
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凝胶电泳系统
DYY-6C型 双稳定时电泳仪电源(北京六一) 输出范围(显示分辨率):6-600V(1V) 4-400mA (1mA) 240W
美电泳槽Mini-Sub Cell GT Cell
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凝胶成像分析系统
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