SNP数据统计详细方法.docx

TTA standardization office【TTA 5AB- TTAK 08- TTA 2C】
SNP数据统计详细方法
SNP操作步骤与结果记录
按照陈丽学位论文第二部——
步骤一、使用在线软件SHEsis检验各个危险的hw遗传平衡（因rs2607659未发生突变，故不纳入分析。）
结论：9个位点P值均大于，均符合HW遗传平衡。（有附件）
步骤二、分析前将协变量进行分类，并用KS法检验连续变量正态性，结果如下：
正态性连续变量 非正态连续变量 分类变量
ALT CR eGFR-A
AST BMI HBeAg
年龄 eGFR 年龄-A
药物浓度 ADV合用
性别
步骤三、用KM生存曲线画出某一位点的CK升高时间与累积危险函数之间的曲线，（KM曲线中状态选项选择服药四年CK数据组）并联合Log-rank检验，比较该位点突变与否对CK结局的差异。
结果：9个位点P值均大于
即：这些位点的变异对CK升高作用无差异。为验证统计操作的正确性，将TK2基因rs3826160位点进行统计，得到的KM曲线与Log-rank P 值与陈丽师姐论文相同。故统计操作正确。
（SPSS输出结果见附件）
步骤四、对协变量进行单因素分析，排除rs位点突变与其他临床因素对CK产生相反作用，掩盖rs位点对CK结局影响的情况。
选择二元Logistic回归（除根据P值定性外，可提供OR值观察因素的影响程度）方法。影响CK的临床因素(P<如下：
协变量 P
性别
药物浓度
年龄
BMI
HBVDNA-A