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太子参谷胱甘肽-S-转移酶基因家族生物信息学及表达分析.pdf


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广⑦録幼 Guihaia Apr. 2021, 41(4) : 535-545 http : /// -journal. com
DOI:
毕艳, 郑伟, 周涛, $转移酶基因家族生物信息学及表达分析[J]. 广西植物, 2021, 41(4): 535-545.
BI Y, ZHENG W, ZHOU T, eL al. BioinlormaLics and expression analysis of gluLaLhione-S-Lranslerase gene family in
Pseudostellaria heterophylla [ J] . Guihaia, 2021, 41(4) : 535-545.
太子参谷胱甘肽-s-转移酶基因家族
生物信息学及表达分析
毕 艳1,郑 伟2,周 涛江维克1,杨昌贵1,肖承鸿1,周太敏1
(, 贵阳550025; , 天津300193 )
摘 要:GSTs (glutathione-S-transferases)是一个普遍存在于植物体内,多基因家族编码的多功能蛋白酶。
为研究GSTs基因家族在太子参中对其生长发育以及活性成分合成调控的潜在功能 ,该文基于隐马尔可夫
模型在太子参中鉴定到30个谷胱甘肽-S-转移酶(PhGSTs)的基因家族成员。结果表明:30个PhGSTs基因
同时具有高度保守的N-端结构域和复杂多变的C-端结构域,分属于6个亚家族,有10个motif区,其中motif
l、motif 2 .motif 3同属于所有家族,motif 4仅属于Tua亚家族。PhGST蛋白质三级结构有明显的相似之处,N
端主要由3个a螺旋和4个p折叠构成papappa结构域,C端均由a螺旋构成,不同亚家族的C端a螺旋
数目及组合方式各不相同,但始终维持相似的三维结构。PhGST基因在太子参植物中具有不同的组织表达
特异性,PhGSTU1、PhGSTU8、PhGSTU9等在太子参块根中优势表达,PhGSTF2在茎和叶中优势表达。水分
胁迫处理后有4个基因积极响应干旱胁迫,PhGSTZl的响应最为明显;同时也有PhGSTU8、PhEFB1Y3等4
个基因随土壤含水量增加呈上调表达。该文鉴定出30个PhGST基因,并分析了其在太子参中的表达模式,
为PhGSTs基因家族在太子参活性成分的合成调控及逆境响应等生理过程中的功能研究奠定理论基础。
关键词:太子参,GSTs,基因家族,生物信息学分析,表达分析
中图分类号:Q941 文献标识码:A 文章编号:1000-3142(2021)04-0535-11
Bioinformatics and expression analysis of glutathione-S-
transferase gene family in Pseudostellaria heterophylla
BI Yan1, ZHENG Wei2, ZHOU Tao1; JIANG Weike1,
YANG Changgui1, XIAO Chenghong1 , ZHOU Taimin1
(1. Guiz

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  • 时间2021-07-18
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