单一顺序和重复顺序.ppt

第三节   单一顺序和重复顺序
一. 单一顺序 (Unique sequence )
二. 重复顺序
短片段的重复顺序可分为三种类型：
（1）(direct repeats)又叫顺向重复；
（2）反向重复(inverted repeats) ；
（3）回文顺序 (Palindromic sequence)
5‘ GTGAGCTCAC 3’
3’ CACTCGAGTG 5’
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单一序列（非重复序列）：
基因在基因组中只有一个或几个拷贝，真核细胞中占40%-70%。真核细胞的大多数基因是单拷贝的，但是单一序列中只有百分之几的序列是编码基因的。而原核基因组中，大多数的单一序列是编码基因的。
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正向重复：
正向重复(direct repeats)又叫顺向重复，这种重复序列的方向是相同的。比如l噬菌体的复制起点中的重复序列以及真核转座因子Ty，copia的两端，插入序列，转座子的两端的宿主序列以及端粒结构等
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3
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反向重复(Inverted repeats )：
同一个序列的两个拷贝在一个分子中以相反的方向重复，相邻重复组成回文序列。
由反方向互补的两个DNA片段组成，两个反转重复序列又叫回文序列(palindrome sequence)。呈两侧对称的序列，常存在于插入序列和转座子两端的结构元件中。
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画上荷花和尚画
书临汉字翰林书
正反相同
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在高度重复序列中，有一种是反向重复序列，也叫回文结构；长度不等，从几个核苷酸到几百个核苷酸等。
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这种反向重复序列在基因组中很多，据推测可能与基因的复制、转录等调控有关。
与DNA结合的蛋白质多以二聚体的形式结合，这时会发现结合位点的DNA多具有回文结构的特点。
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