蛋白质组与蛋白质结构分析.ppt

蛋白质组与蛋白质结构分析
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第六章  蛋白质组与蛋白质
结构分析
中山大学 吴忠道
上海交通大学 魏冬青
生物信息学
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学习提纲
重点
蛋白质的分离与鉴定方法、蛋白质芯片分析技术以及酵母双杂交技术。
蛋白质二级结构预测方法及其软件、蛋白质三维结构预测方法及其软件。
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难点
蛋白质二级结构和三维结构算法以及软件的使用。
蛋白质功能预测方法及其软件的使用。
蛋白质与疾病发生。
常用的蛋白质组学数据库。
熟悉
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第一节 引言
Section 1 Introduction
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随着人类基因组及诸多物种基因组计划的完成，生命科学研究已经进入以基因组学、蛋白质组学、代谢组学等“组学”为研究标志的后基因组时代（post-genomic era）。在后基因组时代，蛋白质组学研究越来越受到关注和重视。
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蛋白质组（proteome）：指由一个基因组（genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质（protein）。
蛋白质组学（proteomics）：蛋白质组学是采用大规模、高通量、系统化的方法，研究某一类型细胞、组织或体液中的所有蛋白质组成、功能及其蛋白之间相互作用的学科。
根据不同研究目的和手段，蛋白质组学分为表达蛋白质组学、结构蛋白质组学和功能蛋白质组学。
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①表达蛋白质组学：主要采用经典蛋白质组学技术如双向凝胶电泳和图像分析技术，开展细胞内蛋白样品表达的定量研究；
②结构蛋白质组学：以绘制出蛋白复合物结构或存在于一个特殊的细胞器中的蛋白为研究目标的蛋白质组学，主要用于建立细胞内信号转导网络图谱并解释某些特定蛋白表达对细胞产生的特定作用；
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③功能蛋白质组学：以细胞在某一特定时间所表达或与某个功能相关的蛋白质集合为研究对象进行研究和描述，能够提供有关蛋白糖基化、磷酸化，蛋白信号转导通路，疾病机制或蛋白-药物之间相互作用的重要信息。
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第二节
蛋白质组数据的获取与分析
Section 2
Proteomics Data Acquisition and Analysis
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