第七章个体遗传评定BLUP教材课程.ppt

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家畜育种学－个体遗传评定-BLUP法Genetic Evaluation-BLUP
第七章
本章主要内容
BLUP的基本原理
单性状动物模型BLUP
多性状动物模型BLUP
遗传参数估计
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环境
样本
1 基本原理
试验模型
模型举例
设有饲喂4种饲料的肉牛的体重资料，欲分析不同饲料对体重的影响。
可建立如下的线性模型：
yij = u + ai + eij
上式中：
yij ：在第i个饲料组中的第j头肉牛的体重，为可观察的随机变量；
 ：总平均数，是一常量；
ai ：第i种饲料的效应，它是固定效应；
eij：剩余效应，也称为随机误差；
模型举例
上式中随机变量的期望和方差及协方差为：
E(eij) = 0，E(yij) =  + ai ，
Var(yij) = Var(eij) = σ2
Cov(eij，eij')= Cov(eij，ei'j)= Cov(eij，ei'j')=0
此模型的假设和约束条件包括：
1) 所有犊牛都来自同一品种,
2) 母亲的年龄对犊牛体重无影响,
3) 犊牛的性别相同或性别对体重无影响,
4) 所有犊牛都在相同的环境下以相同的饲养方式饲养
模型举例
每一观察值都可根据上面的模型建立一个方程式：
y = Xa + e
E(e) = 0，E(y) = Xa
Var(y) = Var(e) = Iσ2
矩阵X称为关联矩阵，因为其中的元素指示了y中的元素与a中的元素的关联情况，I是单位矩阵。
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真实模型：试验过程、本质的真实写照，但是通常并不知晓。
理想模型：依据现有认识所能建立的同真实模型差距最小的模型。
操作模型：兼顾计算手段、分析技术以及使用者的素质等因素而实际采用的模型。
模型水平
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如果对于一个因子我们有意识地抽取它的若干个特定的水平，而研究的目的也只是要对这些水平的效应进行估计或进行比较，则该因子就是固定因子，它的不同水平的效应就称为固定效应。
如果一个因子的若干水平可看作是来自该因子的所有水平所构成的总体的随机样本，研究的目的是要通过该样本去推断总体，则该因子就是随机因子，它的不同水平的效应就称为随机效应。
模型分类