细菌的分类与命名-微生物命名规则.doc

细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名
细菌分类学
细菌分类学(taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与鉴定的一门学科。它的任务就是在全面了用俗名如tuberoulosis (结核杆菌)、typhoid bacilus(伤寒杆菌)等。有时泛指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在属名之后加上sp,如Mycobacterium sp,Salmonella sp,即表示分枝杆菌属与沙门菌属细菌(sp代表菌种species,复数用spp);如果使用1个亚种的名称,则在种名后再加亚种名如Klesbsiella penumoniae subspecies pneumoniae。
命名法典规定,新的细菌名称必须在IJSB发表后,经过世界公认的国际细菌命名裁定委员会公布,菌名批准目录刊登后正式应用。凡有关细菌研究的学术论文必须使用上述正式命名的细菌学名。
细菌分类方法
细菌的分类就是在对细菌的大量分类标记进行鉴定与综合分析的基础上进行的。用作细菌的分类标记有形态学、生理生化学、免疫化学与遗传学等方面的性状。近年来,应用各种现代化技术与设备研究细胞的化学结构与化学组成,分析它们的来源关系,为发展细菌分类学开拓了前景。
一、按表型特征分类法
细菌的形态、染色以及细菌的特殊结构就是最早与最基本的分类依据,众多的理化特征如细菌生长条件、营养要求、需氧或厌氧、抵抗力、菌体成分、能否利用某些糖类与有机酸、蛋白质、氨基酸、代谢途径、代谢产生、呼吸酸、毒性酶、毒素、致病力等也一直作为分类依据。目前,以生理生化学作为细菌分类方法有两种,即传统分类法与数值分类法。
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(一)传统分类法
19世纪以来,以细菌的形态、生理特征为依据的分类奠定了传统的分类基础,它选择一些较为稳定的生物学性状,如细菌的形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据,然后按主次顺序逐级区分。这种方法使用方便,分类亦较为明确,但往往带有一定程度的盲目性。
(二)数值分类法
20世纪60年代,随计算机的应用而发展的细菌分类方法。它对细菌的各种生物学性状按“等重要原则”进行分类,一般需选用50项以上的生理、生化指标逐一进行比较,通过计算机分析各菌间相似度,划分细菌的属与种,并确定它们的亲缘关系。
二、遗传学分类法
遗传学分类就是以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源程度分类。该分类法具有下述的优点:(1)对细菌的“种”有一个较为一致的概念;(2)使分类不会出现经常性或根本性的变化;(3)可制定可靠的细菌鉴定方案;(4)有利于了解细菌的进化与原始亲缘关系。
目前较稳定的基因型细菌分类法有如下几种。
(一)DNA G+C mol/%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100,测定其中G+G或A+T摩尔百分比,能反映出细菌间DNA分子同源程度。不同菌属间的G+Cmol%范围很大,在25%~75%之间,但同一种细菌G+Cmol%相当稳定,不受菌龄、培养条件与其她外界因素影响,亲缘关系越近的细菌,它们G+C mol/%越相近。目前测定的技术多用加热变性