Arlequin的使用说明.docx

Arlequin功能的概述
Moleculardiversity—分子多态性
Mismatchdistribution—错配分布
Haplotypefrequencyestimation—单倍型频率
巾上巾糅川帷巾w水平等
Moleculardiversityindices:隔离位点的数目（s）、单倍型的数目（nh）、单倍型的
多样性（Hd）,.“a口，口口
CompUtetinmubspanningnetWOrka'monghaploiype:二对无侬个居群的单倍型数据
计算最小支撑树和最小支撑扩张网络图。
Moleculardistance:选择遗传距离，|包括配对差异鼻高和核甘酸差异数的百分比。
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Thekta，（hOe）::盘山谷—观测到'的审曲生HH疝傅到一个参数
Theata（s）:通过估计观测到的隔离位点S的个数而得到的一个参数
Theata（k）:通过估计观测到的等位基因K的个数
Theata（兀）通过平均配对差异数而得到的一个参数。
点小AHeqUdconfiguration出现如下的结果
点击Browse，选择要分析的数据，如下图
点击打开如下图
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点击i^ojectwizard|进行碑:置「这里面数据的设置，可H通过」」|viewproject打开的文本格式
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来作为参考，进行设置
点击viewproject出现的文本格式中包含了所要设置的数据的情况
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设置后，出现如下的数据：
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点声Start,就写4j亍苗析，疗会得到丁系竹的“2出斗怦评/一个与原来的名相同的文仁夹，运行的结果是1Htmi文件。''
■AMovA,是指对分子差异性的分析。它通过对所研究居群进行不同层次的归
类和划分，可界定不同的遗传结构并坐红统计学检验，从而估计出群体间、群体内
以及个体间不同层次所表现抑的差异总变异的哆少将丁I这种方法可以讨论不同
-M1LJ
海拔高度、不同语系、以及地理群体间是否存在相应的遗传变异。
LocusbylocusAMOVA每个基因单独进行分子差异性的分析
Includein^individuallevelforgenotypicdata包括个体间金银分歧度协