双酶切连接反应之全攻略
双酶切连接反应之全攻略
前一阵子一直在做双酶切质粒重组,失败了很多次,不过很快改善了实验方法,用2周重
组了14个质粒。现就自己的体会,结合丁香园战友的宝贵经验,谈一下质粒重组的一些个人经验。
1、回收PCR后面的挑克隆中,我只挑选4个就足够
了。然后双酶切鉴定,测序。。。。。。
连接前最好将水、插入片段和载体混合好以后置于45度水浴5min,马上置于冰上冷却,再
力口入buffer和ligase。
就上面的对照简要说一下我的结果。转化后第二天可见14个标本的平皿上长了很多克隆,
约100个左右,我用的是直径6cm的板子,所以仍显较多,(我是先挑半个克隆并标记好
行PCR鉴定后再对另外的一半进行摇菌抽提质粒),较难挑克隆,所以铺皿时不用离心,
直接用100微升的铺皿就可以了,我其中一个是这样做的,长得克隆较大,很好挑选。
下面简要的说一下对照的结果。
A只长出了3个克隆,以100的基数计算,约为3%。即双酶切反应中质粒只有3%进行了单酶切
B约有5个克隆,即质粒完全没被切动的约5%
C长了很多克隆,证明操作系统没有问题。为系统控制指标。
D长了很多克隆,证明感受态没有问题。
这些对照相辅相成,扬长避短。万一什么都没作出来,也好分析原因。
JM108感受态细胞的制备
刚开始做实验时,是向TAKARA购买的,一支30元,定了10支。后来干脆自己做,感觉质量和TAKARA的质量不相上下,下面谈谈我制作感受态的体会。
前期工作
分子生物耗费时间在于准备过程太多。所以做好前期工作非常重要,所谓磨刀不误砍材功
注意事项
,最好从—70c或-20C甘油保存的菌种划板
(AMP阴性)37度过夜培养,划板时用小TIP头挑少许冰渣即可,轻划S行。同时记得设
立对照:A、在AMP阳性板划菌,排出AMP抗性菌污染。大家都知道,实验室很多材料从
B、AMP
师姐传师妹,或许经过很多人的转手。所以从头鉴定所用材料的可靠性非常必要。
阴性空白培基。系统控制参照,为更准确起见,用TIP头不沾任何东西进行划板。第二天挑克隆。
.质粒的质量和浓度:用于转化的质粒DNA应主要是超螺旋态DNA(cccDNA)。转化效率与外源DNA的浓度在一定范围内成正比,但当加入的外源DNA的量过多或体积过大时,转化效率就会降低。1ng的cccDNA即可使50口的感受态细胞达到饱和。一般情况下,DNA溶液的
体积不应超过感受态细胞体积的5%。不过我一般链接反应后(TAKARA的链接酶,体系
25微升)会全量加到200微升的感受态里,约为150ng(,)。效果也好。
.试剂的质量:所用的试剂,如CaCl2等均需是最高纯度的(.),并用超纯水配制,最好分装保存于干燥的冷暗处。国产的当然也可以。我用都是国产的,好像是陇西化学制剂,分析纯。
.防止杂菌和杂DNA的污染:整个操作过程均应在无菌条件下进行,所用器皿,如离心管,
tip头等最好是新的,并经高压灭菌处理,所有的试剂都要灭菌,且注意防止被其它试剂、DNA酶或杂DNA所污染,否则均会影响转化效率或杂DNA的转入,为以后的筛选、鉴定带来不
必要的麻烦。
培养基的配制
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