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蛋白质一级结构与高级结构关系
蛋白质分子就是由氨基酸首尾相连而成得共价多肽链,天然蛋白质分子有自°回折⑵回折部分通常由四个氨基酸残基构成⑶构象依靠第一残基得-CO基与第四残基得-NH基之间形成氢键来维系。
转角结构通常负责各种二级结构单元之间得连接作用,它对于确定肽链得走向起着决定性得作用。
脯氨酸与甘氨酸就是频繁出现在B-转角中得残基。
无规卷曲。无规卷曲繁殖那些不能被归入明确得二级结构得多肽片段。无规卷曲也像其她二级结构一样就是明确而稳定得结构,受侧链相互作用得影响很大。球状蛋白中含量较高,对外界理化因子敏感,与生物活性有关,对外界理化因子极为敏感。
蛋白质二级结构得形成由氨基酸序列决定。稳定蛋白质二级结构主要为氢键。氨基酸R基得大小及带电荷状况对二级结构得形成影响也很大。特定得氨基酸残基有利于形成特定得二级结构。
2．三级结构一个蛋白质得三级结构就是指由二级结构元件构建成得总三维结构,包括一级结构中相距远得肽段之间得几何相互关系与侧链在三维空间中彼此间得相互关系。多肽链借助氢键形成二级结构,在一级序列上相邻得二级结构往往在三维折叠中彼此靠近并相互作用形成超二级结构。由超二级结构进一步装配成相对独立得球状实体——结构域或三级结构。蛋白质折叠形成三级结构得驱动力就是形成可能得最稳定结构。有两种力在起作用,一就是肽链必须满足自身结构固有得限制,包括折叠中a-碳得二面角得限制以及手性效应；二就是肽链必须折叠以便埋藏疏水侧链,就是之与溶剂水得接触降到最小程度。疏水相互作用就是形成特定三级结构得主要动力。
多肽链得二级结构决定于短程序列,三维结构主要决定于长程序列。二硫桥在稳定蛋白质构象中得作用。蛋白质复性实验证明,二硫桥对肽链得正确折叠并不就是必要得,但它对稳定折叠太结构做出贡献。含二硫桥得分子有较小得熵变化,因此稳定。
归根结底,蛋白质得三维结构就是由一级结构决定得。也就就是说三维结构就是多肽链上得各个单键旋转自由度受到各种限制得总结果。这些限制包括肽键得刚性平面性质、肽链中疏水基与亲水基得数目与位置、带正电荷与负电荷得R基得数目与位置以及溶剂与其她溶质等。在这些限制因素下通过R基团得彼此相互作用以及R基团与溶剂与其她溶质相互作用,最后达到平衡,形成了在一定条件下热力学上最稳定得空间结构。即复杂生物大分子“自我装配”原则。
3．四级结构自然界中很多蛋白质以独立折叠得球状蛋白质得聚集体形式存在。这些球状蛋白质通过非共价键彼此缔合在一起。缔合形成具集体得方式构成蛋白质得四级结构。稳定司机结构得作用力与稳定三级结构得没有本质区别。亚吉蒂特得驱动力主要就是疏水作用,亚基缔合得专一性则由相互作用得表面上得极性基团之间得氢键与离子键提供。
蛋白质四级结构就是建立在三级结构基础上得,单体蛋白质甚至不存在四级结构。因此蛋白质四级结构得形成仍然由一级结构决定。
（三）测定蛋白质一级结构得应用推测蛋白质高级结构。蛋白质得一级结构可通过多种方法测定。由于二十种氨基酸在几种二级结构中出现得频率就是不同得、进而求出每一种氨基敌得构象参数,可以由此预测蛋白质得二级结构。我们进一步从肽键得统计分析出发,指出二肤与三肤得关