扫描实时微流体热循环仪和用于同步的热循环和扫描光学检测的方法.docx

扫描实时微流体热循环仪和用于同步的热循环和扫描光学检测的方法
扫描实时微流体热循环仪和用于同步的热循环和扫描光学检测的方法
进行同时核酸扩增和检测的系统和方法。该系统和方法包括处理多个协议连同指导传感器阵列通过多个反应室中每个的方法。在一些实施方式中，。在一些实施方式中，将至少部分孔板电化学地氧化以比当孔板未被电化学地氧化时更黑。在一些实施方式中，当盒存在于容器中时，孔板提供通过(across)微流体盒区域的基本上均匀的压力。在一些实施方式中，孔板包括铝、锌或镍中至少一个，孔板进一步包括着色剂。
[0013]在一些实施方式中，装置进一步包括加热器板，其中当盒存在于容器中时将加热器板安置于微流体盒下面。在一些实施方式中，加热器板包括玻璃或石英中至少一个。在一些实施方式中，当盒存在于容器中时，孔板提供通过微流体盒区域的基本上均匀的压力。基本上均匀的压力可促进微流体反应室和加热器板之间基本上均匀的热接触。像这样，在一些实施方式中，孔板提供均匀的压力，其可保证微流体盒中多个反应室或反应器中的每个与位于加热器板内多个加热元件的各个均匀地热接触或联系。
[0014]在一些实施方式中，装置进一步包括光检测器，光检测器位于孔板之上，其中配置微流体室以相对于光检测器在掠射角从光源接收光。在一些实施方式中，加热器板包括多个加热元件，其中安置多个加热元件中的每个，以便当微流体盒存在于容器中时，多个加热元件分别与多个反应室中的每个热连通。
[0015]某些实施方式考虑在一个或多个计算机处理器上执行的用于优化协议(protocols),如聚合酶链反应(PCR)协议等，同时进行多个热循环反应的方法，其中每个热循环反应包括一个或多个检测步骤，和其中热循环反应在多个反应器中进行。该方法可包括以下步骤:测定或提供或访问多个反应器中每个的检测循环时间；接收或访问协议步骤，该步骤与步骤持续时间相关，该步骤包括检测时间；和测定对步骤的第一调节以便步骤持续时间是多倍检测循环时间。
[0016]在一些实施方式中，该方法进一步包括测定对步骤的第二调节，其中当步骤由第一调节和由第二调节来调节时，检测时间是多倍检测循环时间。在一些实施方式中，该方法进一步包括基于与协议相关的反应室的位置测定起始偏移调节(starting offsetadjustment)。在一些实施方式中，检测循环时间包括检测器头对反应器进行预设的多个检测所需要的时间量。在一些实施方式中，检测循环时间包括检测器头运动到多个反应器中的每个和检测器头运动到起始位置所需要的时间。在一些实施方式中，该方法进一步包括启动该协议。
[0017]某些实施方式考虑包括指令的永久性计算机可读介质，配置该指令以引起一个或多个处理器进行以下步骤:测定或提供或访问检测循环时间；接收或访问协议步骤，其中该步骤与步骤持续时间相关，并且其中步骤包括检测时间；和测定对步骤的第一调节以便步骤持续时间是多倍检测循环时间。
[0018]在一些实施方式中，协议步骤与来自多个协议的协议相关。多个协议中的每个可与多个热循环反应，如聚合酶链反应(PCR)协议中至少一个相关，其中每个热循环反应包括一个或多个检测步骤，并且当多个协议中的两个或多个同时运行时，其中测定第一调节至少部分基于一个或多个与多个协议中至少两个或多个的热循环反应相关的检测步骤的计时。在一些实施方式中，该方法还包括测定对步骤的第二调节的步骤，其中当步骤由第一调节和由第二调节来调节时，检测时间是多倍的检测循环时间。在一些实施方式中，该方法还包括基于与协议相关的反应室的位置测定起始偏移调节的步骤。在一些实施方式中，检测循环时间包括检测器头对反应室进行预设的多个检测所需要的时间量。在一些实施方式中，检测循环时间还包括检测器头运动到多个反应室检测位置中的每个和检测器头运动到起始位置所需要的时间。在一些实施方式中，该方法进一步包括启动该协议。
[0019]某些实施方式考虑优化针对多个反应室的协议的系统。该系统可包括处理器，其被配置以进行以下操作:测定或提供或访问检测循环时间；接收或访问协议步骤，其中该步骤可与步骤持续时间相关，和其中该步骤包括检测时间；和测定对步骤的第一调节以便步骤持续时间是多倍检测循环时间。
[0020]在一些实施方式中，协议步骤与来自多个协议的协议相关。多个协议中的每个可与多个热循环反应，如聚合酶链反应(PCR)协议中至少一个相关，其中每个热循环反应包括一个或多个检测步骤，并且其中当多个协议中的两个或多个同时运行时，测定第一调节至少部分基于一个或多个与多个协议中至少两个或多个的热循环反应相关的检测步骤的计时。在一些实施方式中，还配置处理器以测定对步骤的第二调节，其中当步骤由第一调节和由第二调节来调节时，检测时间是多倍检测循环时间。