晶体结构微机解析系统—NOMCSDP程序包.pdf.pdf

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药牮学报;:~
烈~ 晶体结构微机解析系统
——程序包
陴
中国科学院生物物理研究所,北京;
”中国医学科学院药物研究所,北京
提要晶体结构分析程序包——. Ⅲ
。它不但能够完成射线
晶体结构分析的垒过程,而且还适用于中子衍射晶体结构计算。有操作简便,晶体
学专门知识干预少,解析能力强,功能齐垒等优点。作者以天然产物分子结构测定为线索,论述

的实际应用我们期望这个版本在促进晶体结构分析常规化的进程中发挥积投作用.
关键词晶体结构分析:微机
自六·年代初应用射线晶体结构分析法测定了天然产物——
氨基酸和紫草乌碱乙等三个晶体结构后,历经余年的发展,迄今国内已测定近个新
天然产物的晶体结构它们都是来自我国的中草药和特有的动植物体这些晶体结构的测定
为化学家研究有机化台物精确的立体结构,结构与生物活性关系等方面提供了信息和实验数
据。现在射线晶体结构分析已发展成为化学学科中最有力的分子结构测定方法之一。而
天然产物分子结构测定,目前通常采用红外、紫外,桉磁和质谱等“四谱分析方法化学家依据
这些渡谱中特定的结构信息,经过综合分析而确定分子结构。与四谱方法不同的是,晶体
衍射提供的信息量大通常从一个晶体可收集数千个衍射强度数据,而且结构的解析过程被
一套晶体学的数学内容复盖,致使一部分化学家一时难于掌握。计算机的应用虽然加速了这
一运算过程,规范了晶体学的标准数学运算,但仍限于具备晶体学知识的人完成结构分析。
然而七十年代以来,由于微处理器微型计算机简称微
机的出现与突飞猛进的发展,进入八十年代,一些实验室“开始将晶体学界通用的程序如
,,,和等移植于人们普遍使用的微
机系统上这就为实现射线晶体结构的常规化解析奠定了基础,
拽们选定天然有机分子为实现射线晶体结构常规解析的对象是基于:它们具有分
子结构的骨架:成键原子,,,, 和间具有确定的键长键角平均值:组成天
然有机分子的重原子,, 可视为晶体学中的等同原子:晶态下分子的对称排列符
合密堆积规律,集中于个空间群中的,—,,//,/,
,和等少数的低级晶系群,而近% 以上的天然有机分子晶体的对称
群又集中于,/和等三个空间群中。这些鲜明的特点,使得在进行晶
体学计算时,可引入某些简化处理,从而实现射线晶体结构的智能化解析
本文于年月日收到
‘国亲自然科学基盘资助项目
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~软件进行了多方面的改进后在微机上开发的第一个
程序包:
增加和提高了数据转换和处理方面的功能:
多方面提高了整个系统智能化运行的能力:
增加了系统的新功能如中子衍射晶体结构计算;
具有直接使用国际上某些流行的分子图像软件的能力。
程序包
工作系统
程序包是运行在或兼容的, ,和等
微机上的射线晶体结构的解析系统。该系统对微机的基本要求是:内存,可供
使用的硬盘空间不;显示设备最好为或方式,有,
或协处理器:打印机一台如或九针打印机:操作系统为
—或—.版本。
内容
系统是参考和—系统开发而成的