中国南部沿海条纹斑竹鲨和尖头斜齿鲨种群遗传学研究.pdf

厦门大学
博士学位论文
中国南部沿海条纹斑竹鲨和尖头斜齿鲨种群遗传学研究
姓名:陈骁
申请学位级别:博士
专业:海洋生物学
指导教师:杨圣云
20080701
摘要南�№、粤西���鎏跷瓢咧聆璧乩砣禾逡糯ǘ嘌�院鸵糯ń峁梗�峁�砻鳎��鏊�以鲨、鳐类为代表的软骨鱼类主要生活在海洋中,大约有���帧W魑J澄锪吹�顶级捕食者和海洋生态系统的重要组成部分,软骨鱼类会对许多其他海洋生物的种群结构产生影响。因此,当软骨鱼类遭到过渡捕捞后将严重影响海洋生态系统中生物群落组成及生态环境。研究发现,相对于硬骨鱼类,大部分鲨、鳐类具有生长缓慢、成熟期长、生殖力低的特点。这些特点导致其具有较低的内禀增长率以及在捕捞压力下较低的种群恢复能力。因此,大部分软骨鱼类种群只能承受中等捕捞强度的渔业开发,否则将导致种群数量急剧减少甚至种群崩溃,并且在种群数量急剧减少后无法象许多硬骨鱼类那样快速恢复原有种群数量和规模。当前鲨鱼渔业在世界范围内快速发展,,渔业捕捞有可能在自然选择之前造成鲨鱼的灭绝。在这种情况下,鲨鱼的种群遗传学研究显得十分重要。但是由于鲨鱼外部形态特征较少,无法反映其种群个体间的遗传差异,所以难以运用传统的标志放流观察和测量等方法进行种群遗传学研究。从��年代同工酶电泳技术的发展开始,分子标记技术越来越多地应用在鲨鱼种群遗传学的研究中。分子标记直接针对基因进行分析,不受环境因素、生物个体发育阶段及器官组织变化的影响,能直接揭示鲨鱼个体间和群体间的遗传差异,成为鲨鱼种群遗传学研究的有力工具。目前国外已经有大量关于软骨鱼类种群遗传学的研究报道,但是国内在这方面的研究还未见报道。因此作者利用分子标记技术对我国南部沿海两种有代表性的鲨鱼种类�跷瓢咧聆韬图馔沸背蓥�的种群遗传学特征进行研究,充实我国软骨鱼类种群遗传学的基础理论,并为我国软骨鱼类保护和资源合理开发提供科学依据。采用随机引物扩增多态性�����际醴治隽酥泄�喜垦睾C龆���⒚�机引物在这�鋈禾逯泄布觳獬��个位点,各群体检测出的位点数分别为����、���渲卸嗵�坏闶�直鹞�������嗵�坏惚壤�直鹞����ァ����ァ����ィ��鋈禾宓腟���多样性指数分别为�����.��、����槐砻魈跷瓢咧聆枞禾宓��;
���劾喾治鼋峁�允咎跷瓢咧聆璧幕�蚪涣髂�式属于沿海岸线的距离隔离模式,遗传差异大小与地理距离远近相关。分子方差分析����峁�允救禾寮浯嬖谙灾�囊糯ń峁共钜�������,����,变异主要发生在群体内部���%���灾泄�喜垦睾�个海域的条纹斑竹鲨群体线粒体控制区序列多态性进行研究,获得长度为��~����南吡L蹇刂魄�暾�蛄校���蛄斜榷裕�⑾至�个多态性核苷酸位点,定义了�龅ケ缎汀�个群体的单倍型多样度���.��������、平均核苷酸差异��.����������和核苷酸多样度�������������均处于较低水平。分子方差分析����峁�允救禾寮浯嬖谙灾�囊糯ń峁共钜�风��.���琍�.����湟熘饕7⑸�谌禾迥诓��.��。遗传距离分析显示各群体间的遗传差异大小与地理距离远近相关。系统地理学分析显示闽南群体最古老,其余群体是由闽南群体扩张发育而来。�捎盟婊��锢┰龆嗵�訢����技术对中国南部沿海闽东霞浦一浙南瑞安海域��、闽南一台湾浅滩渔场��、粤西湛江一阳江海域��、北部湾海域���个尖头斜齿鲨地理群体遗传多样性进行分析,�个随机引物在�鋈禾逯泄�检测出��鑫坏恪�个群体各自检测出的位点数分别为����、����,其中多态位点数分别为�、�、�、�,多态位点比例分别为�.�%、�.�%、�.�%、�.�%。����嘌�灾甘�直鹞�.���.���.���.���砻骷馔沸背蓥枞禾宓囊糯ǘ�样性水平较低。遗传距离和���劾喾治鼋峁�允炯馔沸背蓥璧幕�蚪涣髂J绞粲�距离隔离模式,遗传差异大小与地理距离远近相关。分子方差分析����峁��示群体间存在微弱但显著的遗传结构差异���.��琾�.���湟熘饕7⑸�谌禾�内部�����。‘�灾泄�喜垦睾�个海域的尖头斜齿鲨群体线粒体控制区序列多态性进行研究,获得长度为���的线粒体控制区完整序列,经过序列比对,发现了�个多态性核苷酸位点,定义了�个单倍型。�鋈禾宓牡ケ缎投嘌���������.���⑵骄��苷酸差异��.���������和核苷酸多样度�������������均处于较低水平。分子方差分析����峁�允救禾寮浯嬖谖⑷醯�灾�囊糯ń峁共钜����.���琍�.���湟熘饕7⑸�谌禾迥诓��.�%�R糯ň嗬敕治鱿允靖�群体问的遗传差异大小与地理距离远近相关。系统地理学分析显示祖先单倍型在