蛋白质三级结构.ppt

§1-5 结构域
三级结构的基本单位是结构域。一个结构域指的是一条多肽链或能够独立折叠为稳定的三级结构的多肽链的一部分。但然,结构域也是一个功能单位,通常蛋白质中不同的结构域是和不同的功能相关的。
一个蛋白质可以只包含一个结构域或者是由几个结构域组成。脂肪酸的合成需要七种不同的催化反应,在植物的叶绿体中,这些反应由七种不同的酶所催化,而在哺乳动物中,这些反应则由一条多肽链的七个结构域来完成。
蛋白质结构分类: -结构域、-结构域/ 结构域, +结构域,小二硫键丰富的折叠。
一、蛋白质的-结构域结构
-结构域结构由一束-螺旋组成,这些-螺旋由结构域表面的环区域相连接。-螺旋互相成对堆积,以使得每一个-螺旋的一边提供疏水侧链以形成疏水内核,而另一边则面对溶液
四个-螺旋折叠为一个四螺旋束
-螺旋的球状折叠
二、蛋白质的反平行-结构域结构
反平行的-结构构成了第二大类的蛋白质的结构域结构。从功能上来说,这一类的蛋白质是最分散的,它包括酶、输运蛋白、抗体和病毒外壳蛋白等。这个结构域的内核由四到十几个-链所构成。这些-链主要以反平行的方式排列,并形成两个交联在一起并互相堆积的-回折。
-回折有正常的扭曲,当两个扭曲的-回折堆积在一起时,它们形成一个桶状的结构。因此,反平行的-结构一般说来在桶内有一个由-链的残基提供的疏水侧链的核。
1、上—下桶形拓扑学结构上—下-回折(up-and-down -sheets)或称桶(barrels)
2、反平行-结构中的希腊图案花样
我们要把链n与另一条反平行的-链相连,但不要使它和相邻的第n+1或n-1条-链相连。仅有两种可能性:一种是与第n+3个-链相连;另一种是与第n-3个-链相连