基于融合特征的蛋白质亚细胞定位预测.pdf

勋姓名盈驱叠;基于融合特征的蛋白质亚细胞定位预测湖南大学高校教师硕士学位论文埴堂僮虫造厶丝刍;因虫差杨胜副塾援皇僮焦星抖堂皇工猩堂医迨宴提童旦期生垒旦鱼旦诠塞簦迸旦甥;生垒月ǖ学校代号:学密号:级:普通
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枷作者签名:、曷呷美雨呷粜日期:加勰月弓日湖南大学学位论文原创性声明日期:.加年鹿学位论文版权使用授权书月丫日本人郑重声明:所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的成果作品。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定,同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权湖南大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本学位论文属于⒈C芸冢年解密后适用本授权书。⒉槐C芑亍朐谝陨舷嘤Ψ娇蚰诖颉啊ⅲ作者签名:导师签名:日期:
摘要定出来,单纯的生物实验已经无法填补大量序列信息与严重不足的蛋白质功能注酸局部顺序信息,我们将每个氨基酸残基用五位氡硎荆敲疵刻鮈长度的蛋白质序列,局部顺序信息可以用一个蠰列的矩阵表示,之后我们再计算随着人类基因组计划的顺利完成,越来越多的蛄泻偷鞍字市蛄斜徊释之间的空隙,而且既耗时,成本又高,所以迫切的需要通过计算的方法来预测蛋白质功能。然而,另有生物学研究表明,蛋白质功能与蛋白质亚细胞定位是密切相关的,蛋白质亚细胞定位信息可以为蛋白质功能的研究提供有用的线索。因此为了进一步了解蛋白质的功能,识别蛋白质的亚细胞定位成为了蛋白质组学的一个重要研究方向。本文主要围绕这一主题,针对蛋白质序列的编码方法和分类预测算法两方面进行了研究,并在不同的数据集上分别进行了测试和分析。本文的主要创新工作概括如下:本文提出了一种新的蛋白质序列编码方法,该方法由三个序列特征融合而成,第一个序列特征为传统的维的氨基酸基本组成,第二个序列特征为氨基酸位置信息,主要提取了每个氨基酸残基在序列中的位置信息,第三个序列特征为氨基该矩阵每行四联体出现的频率。在本文中,我们采用最近邻分类算法作为预测分类工具,在两个不同的凋亡蛋白数据集上进行测试,并在该这两个数据集上进行自检验和刀切法检验,由实验结果可知,此方法获得了较好的预测效果,与其他方法相比,也具有明显的优势。关键词:亚细胞定位;序列编码;特征提取;氨基酸组成;最近邻算法基于融合特征的蛋白质Ⅱ细胞定位预测
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