蛋白质的高级结构超二级结构和三、四级结构.ppt

蛋白质的高级结构超二级结构和三、四级结构一级结构:氨基酸序列及二硫键位置二级结构:α螺旋,β折叠 超二级结构Module结构域(domain)三级结构:所有原子空间位置四级结构:蛋白质多聚体蛋白质的结构层次高级结构超二级结构(Supersecondarystructure)超二级结构是介于蛋白质二级结构和三级结构之间的空间结构,指相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,排列形成规则的、在空间结构上能够辨认的二级结构组合体,并充当三级结构的构件(blockbuilding),其基本形式有αα、βαβ和βββ等。多数情况下只有非极性残基侧链参与这些相互作用,而亲水侧链多在分子的外表面。超二级结构类型形成αα超二级结构的作用力形成βαβ超二级结构的作用力β-sheet的拓扑学规律超二级结构SupersecondaryStructure超二级结构的类型:keratin,myosin,、:拥有β-sheet的蛋白质αα:α螺旋的侧链位置的20度错位βαβ:Rossman折叠(α螺旋处于β折叠片上侧)发夹曲折希腊钥匙拓扑结构超二级结构是一种由两股右手-螺旋彼此缠绕而成的左手超螺旋(superhelix),重复距离约140Å。是-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白(protomyosin)和纤维蛋白原(fibrinogen)中的一种超二级结构。由于形成超螺旋,(),沿轴有一定的倾斜,Å。螺旋之间的相互作用由侧链的装配控制,螺旋之间可能作用的侧链是非极性的,它们向着超螺旋内部,避开与水接触,其他的是极性的,处于分子的表面,与水接触。超螺旋的稳定性主要由非极性侧链间的范德华力相互作用的结果。超螺旋细胞色素C的结构αα是一种α螺旋束,经常是由两股平行或反平行排列的右手螺旋段相互缠绕而成的左手卷曲螺旋或称超螺旋。α螺旋束中还发现有三股和四股螺旋。卷曲螺旋是纤维状蛋白质如α-角蛋白、肌球蛋白和原肌球蛋白的主要结构元件,也存在于球状蛋白质中。