生物信息学分析流程图基因功能注释基因注释主要基于蛋白序列比对,将基因的序列与各数据库进行比对,得到对应的功能注释信息。注释的蛋白库为:KEGG、COG、SwissProt、TrEMBL、NR。B-6KEGG代谢通路二级分类图B-9KEGG代谢通路二级分类图B-6COG功能分类图B-9COG功能分类图B-6GC含量、GCskew、COG注释基因组分布图B-9GC含量、GCskew、COG注释基因组分布图基因家族(genefamily) 和基因簇(genecluster)/Ks结果gene_families包含各基因家族的序列等信息基因组中来源相同,结构和功能相关的基因聚集在一起形成基因家族。基因家族的各个成员紧密成簇排列成大段的串联重复单位,分布在某一条染色体的特殊区域测序数据的解读与分析解读策略木质素基质是非常巨大的非均性高分子,会受到细胞外酶或试剂的作用;木质素不含有可水解的化学键,这就意味着木质素降解所参与的酶必须具有氧化性;木质素具有立体结构不规整性,与许多其他天然高分子相比,木质素降解要求更具非特异性的作用。木质素降解过程中涉及到的细胞外酶主要有:木质素过氧化物酶(LiP)和锰过氧化物酶(MnP),以及漆酶(Lac)。此外,一些附属酶参与过氧化氢的产生,乙二醛氧化酶(glyoxaloxidase,缩写作GLOX)和芳基醇氧化酶(arylalcoholoxidase,缩写作AAO)属于这类酶。
细菌全基因组测序优质课件 来自淘豆网m.daumloan.com转载请标明出处.
