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细菌全基因组测序.ppt

文档分类：高等教育 | 页数：约20页举报非法文档有奖

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文档列表 文档介绍

基因组测序
和组装流程
生物信息学分析流程图
基因功能注释
基因注释主要基于蛋白序列比对,将基因的序列与各数据库进行比对,得到对应的功能注释信息。
注释的蛋白库为:KEGG、COG、SwissProt、TrEMBL、NR。
B-6 KEGG代谢通路二级分类图
B-9 KEGG代谢通路二级分类图
B-6 COG功能分类图
B-9 COG功能分类图
B-6 GC含量、GC skew、
COG 注释基因组分布图
B-9 GC含量、GC skew、
COG 注释基因组分布图
基因家族(gene family)和基因簇(gene cluster)分析

基因家族聚类结果

各基因家族统计信息
distance_data/
各基因家族内基因两两间的Ka/Ks结果
gene_families
包含各基因家族的序列等信息
基因组中来源相同,结构和功能相关的基因
聚集在一起形成基因家族。
基因家族的各个成员紧密成簇排列成大段的串联
重复单位,分布在某一条染色体的特殊区域

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