01-从0搭建R语言数据分析平台.doc

从0开始搭建R语言数据分析平台本文从实用的角度,一步步搭建一个基于R语言的数据分析和可视化(作图)平台,完成相关的系统配置和软件设置,达到“拿来即用”的目的。本文是“R语言基础系列”的第一篇,该系列共分3篇,第二篇讲R语言的基本操作,第三篇讲R语言的基本图形。这一系列的介绍完成之后,读者已经可以利于R语言进行基本的数据管理、分析和可视化工作。本文包括3个部分:1、下载和安装R、RStudio;2、相关配置和设置;3、一些常见问题。完成后的样子如下图所示:1、下载和安装R、RStudio这两个软件都是开源软件,均可在网上自由下载,不需要付费注册。R支持win7以后的系统,winXP已经不再支持。下载R的时候要选择国内的镜像站点,这样速度更快。第一次安装选择“base”选项。进入下载页面,选择最新版本():。这个文件包含32bit和64bit两个版本的组件,所以不管系统是32bit还是64bit都只下载这一个文件。。该文件是一个可执行文件(.exe),在windows系统中双击即可运行。下载RStudio时,选择RStudioDesktopFree(桌面版免费版)。若是64位系统,则直接下载最新版本,,下载老版本,:安装R和RStudio:首先,运行R--,下一步,设置安装目录,选择安装组件。在“选择组件”这一步要注意区分32-位和64-位windows系统。若是64-位系统则全选,若是32-位系统则取消64-bitFiles。下一步,接受默认设置即可。下一步,,稍后用RStudio关联。等待安装完成。接下来安装RStudio:双击运行安装程序,下一步选择安装目录,下一步安装,等待安装完成即可。2、相关配置和设置(1)设置环境变量:涉及系统对R的调用。右击计算机-属性-高级系统设置:再点击右下角的“环境变量”:然后编辑系统变量PATH的值,在原有值后面添加R启动文件的位置,与原有值之间用英文分号“;”隔开,如:“;D:\ProgramFiles\R\R-\bin\x64”.(2)RStudio界面的设置:Tools–GlobalOptions–Appearance中设置编辑器主题(Editortheme),找一个黑色背景,这样在长时间编写、阅读代码时眼睛受光线刺激较小。(3)R软件库的设置:Tools–GlobalOptions–Packages中设置一个中国的镜像,这样安装软件时速度较快。(4)设置面板:在RStudio工具栏中有一个田字格状的按钮,可以设置面板的样式,将R控制台放在右侧(ConsoleonRight),这样可以并排查看脚本编辑器代码和已运行的R控制台代码。(5)安装R中常用的包:agricolae(农业田间试验)、nlme(非线性混合模型)、xlsx(excel文件读写)、reshape2(数据转换)、ggplot2(高级作图)、gplots(热图作图)、lme4(线性混合模型)、emmeans(边际效应)、psych(相关分析)、pView(多重比较)。图形化操