会计学
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为何要绘制遗传图与物理图?
1)基因组太大,必需分散测序,然后将分散的顺序按原来位置组装,需要图谱进行指导 。
2)基因组存在大量重复顺序,会干扰排序,因此要高密度基因组图。
3)遗传图和物理图各有优缺点,必须相互整合校正。
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结构基因组的研究策略
结构基因组的研究策略
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基因组测序的策略---由上至下(左)和由下至上的测序(右)
克隆重叠群指
导的测序
重叠群(contig): 指相互间存在重叠顺序的一组克隆。
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Clone-by-clone测序
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鸟枪法测序
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混合法测序(Hybrid strategy)
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一 、遗传图谱与物理图谱
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§2 遗传学图谱
§
遗传图
遗传图是应用遗传学分析方法将基因或其他DNA顺序
标定在染色体上构建的连锁图。
这一方法包括杂交实验,家系分析等。
遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义为1%交换率。
物理图
物理图是应用分子生物学技术来直接将DNA分子标记、
基因或克隆标定在基因组实际位置。
物理图的距离依作图方法而异,如辐射杂种作图的计算
单位为厘镭(cR), 限制性片段作图与克隆作图的图距为
DNA的分子长度,即碱基对(bp, kb)。
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§2 遗传学图谱
§ 遗传作图的标记
遗传标记的类型:
基因标记
DNA标记
遗传标记的特征:
亲本间存在着多态性(即差异),也就是说具有可识别性。
亲本间存在的多态性在后代中可以重演,即具有可遗传性。
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