基于Bootstrap方法的基因表达谱数据互信息估计研究.pdf

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第 7 卷 第 1 期 　　　生 物 信 息 学 Vol 7 No 1
　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　　　　
2 0 0 9 年 0 3 月 China Journal of Bioinformatics March ,200
基于 Bootstrap 方法的基因表达谱数据互信息估计研究
徐宏强1 ,王新伟1 ,李园园2 ,罗若愚2
(1. 华东师范大学计算机科学技术系 ,上海 200063 ;2. 上海生物信息技术研究中心 ,上海 200235)
摘要 :基因调控网络模型为深入理解生命本质提供了一个新的研究框架和平台 。作为基因调控网络模型的其中一种 ,互信息
关联网络模型使用熵和互信息描述基因和基因之间的关联 。本文描述了用互信息度量基因表达相似性的方法 ,提出基于
Bootstrap 的互信息估计算法 ,并对产生的偏离现象提出了改进策略 。实验结果表明 ,改进的互信息估计方法可以有效提高基
因表达相似性估计的精确度 。
关键词 :基因表达谱数据 ;互信息 ;Bootstrap ;生物信息学 ;
中3 图分类号 :TP301 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1672 - 5565(2009) - 01 - 52 - 03
Mutual Information Estimation Research of Ge