关于提高生物类专业《生物信息学》教学的一些建议.doc

关于提高生物类专业《生物信息学》教学的一些建议.doc1 关于提高生物类专业《生物信息学》教学的一些建议摘要:生物信息学作为生命科学研究的强有力的辅助工具,是生物类专业学生必须掌握的一门知识。本文作者结合自身教学实践探索, 针对生物类专业本科生的生物信息学教学实践中存在的一些问题, 提出在教学大纲、教学内容、教学方法方面的建议, 希望能够为从事生物信息学教学工作者提供参考。关键词:生物信息学;教学方法;实践中图分类号: 文献标志码: A 文章编号: 1674-9324 ( 2016 ) 32-0219-02 生物信息学是在生命科学、计算机科学和数学的基础上逐步发展而形成的一门新兴交叉学科, 其实质就是利用信息科学与技术对生物数据进行获取、处理、存储、发布、分析和解释, 进而揭示纷繁复杂的数据中所蕴含的生物学本质[1] 。作为21 世纪生命科学领域发展最为迅速的学科之一, 生物信息学已经成为生命科学研究领域的重要学科[2] 。实验室的每一项技术, 从简单的基因克隆、基因数据分析到生物大分子进化研究都需要应用到生物信息学, 因此, 对于生物类专业的学生而言, 掌握生物信息学的相关知识尤为重要。我国各大专院校都在不断努力创新和改进现有生物信息学课程的教学方法与方式。因此, 作者结合近五年来开设生物信息学课程的教学实践, 分析了目前生物信息学课程教学中存在的主要问题, 提出几点建议, 希望能够有助于推动生物类专业生物信息学课程教学质量的提 2 高。一、生物类专业生物信息学课程教学中的问题 1. 生物信息学教材的选择。生物信息学的发展速度快、内容广泛,目前很多国内高校使用的教材多为国外教材的影印版或者中文翻译版本,国内引进的生物信息学相关的英文原版教材中有些属于科普性质, 内容过于简单,而有些偏重介绍生物信息学的计算方法或模型的建立,过于复杂[3] 。而国内相关教材更新较慢,课堂内容涵盖的知识面和知识点相对减缩, 而且一些前沿的数据和先进软件没有讲授, 这些对学生的发展和生物信息知识的合理运用极为不利[4] ,因此,目前导致很多高校教师无法选择适用于生物类专业的生物信息学教材。 2. 教学大纲安排不合理。生物信息学是一门集分子生物学、计算机科学和数学等多个学科的交叉学科,它囊括了基因数据获取、基因预测、序列比对、序列拼接、分子进化、蛋白质序列分析、蛋白质结构预测、分子建模、药物设计以及基因芯片蛋白芯片等内容模块, 同时各领域内容还涉及到具体的计算方法、概率统计、机器语言等知识模块。由于课时设置有限, 如果教师在课堂教学对各领域内容面面俱到, 会造成大部分内容都只是蜻蜓点水, 学生学完以后虽然接触了很多东西, 但在生物研究中遇到实际问题还是束手无策。 3. 教学内容滞后。生物信息学是一个快速发展的学科, 随着生物学科自身的发展和研究的深入, 新的数据库和信息资源不断涌现, 各种数据库和软件的更新换代非常频繁,如果教师所讲授的在线服务器、分析软件、讲解实例都不是当前最普遍的, 学生学完后打开最新的在线服务器或是相 3 关分析软件依然不会操作。 4. 教学方法和教学手段存在不足。生物信息学教学普遍采用普通教室多媒体讲授, 而生物信息学课程是一个实践操作课, 学生经常要动手操作, 普通多媒体教学与实践操作教学相脱节。传统的讲授很难与实践教学效果相比, 很多学生虽完成了生物信息学课程学习, 也接受了很多生物信