下载此文档

GROMACS快速用户指南.docx

文档分类：IT计算机 | 页数：约1页举报非法文档有奖

1/1

下载提示

1.该资料是网友上传的，本站提供全文预览，预览什么样，下载就什么样。
2.下载该文档所得收入归上传者、原创者。
3.下载的文档，不会出现我们的网址水印。

同意并开始全文预览

(约 1-6 秒)

1/1 下载此文档

文档列表 文档介绍

GROMACS快速用户指南2014年H月
中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心版本信息
Gromacs-
要求使用bsub提交作业，详情请见“元”（作业调度系统使用）软件信息
.平台：x86GROMACS快速用户指南2014年H月
中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心版本信息
Gromacs-
要求使用bsub提交作业，详情请见“元”（作业调度系统使用）软件信息
.平台：x86_64
版本：Gromacs-5. 0. 2
目录信息
软件安装在/soft/apps/Chem/gromacs/5. 0. 2下设置环境变量
在~/. bashrc文件尾部加载如下内容：
module unload compilermodule load compiler/intel/composer_xe_2013_spl. 0. 080
module unload mpimodule load mpi/impi/4. 1. 3. 049
source /soft/apps/Chem/gromacs/5. 0. 2/cpu/bin/bsub提交作业范例（请根据需要修改相应参数）
进入数据所在目录：
串行任务
bsub -W 5 -n 1 -q cpu -o % J. out -e % J. err 〃mpi mdrun_mpi - g md. log”
并行任务
bsub -W 5 -n 20 - q cpu -o % J. out - e % J. err 〃mpi mdrun_mpi - g md. log”临时文件
目前默认的都是在数据所在目录下。

GROMACS快速用户指南来自淘豆网m.daumloan.com转载请标明出处.