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0蛋白质的结构
（二）、蛋白质的一级结构(primary structure) （初级结构、肽链结构、化学结构）
1. 定义：指蛋白质分子中氨基酸连接成肽链的方式和排列顺序。是蛋白质最基本的结构,它是由基因上遗传密码的排列顺序决定的1=Glu、Asp(磷酸缓冲液); R1=Glu (磷酸缓冲液或醋酸缓冲液)
精氨酸蛋白酶： R1=Arg
肽链
水解位点
谷氨酸蛋白酶和精氨酸蛋白酶
化学法：可获得较大的肽段
溴化氰(Cyanogen bromide)水解法，它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成的肽键。
多肽链的选择性降解
化学法：可获得较大的肽段
羟胺（NH2OH）：专一性断裂-Asn-Gly-之间的肽键。也能部分裂解-Asn-Leu-之间的肽键以及-Asn-Ala-之间的肽键。
多肽链的选择性降解
胃蛋白酶：R1= Phe、Trp、Tyr或其它氨基酸
嗜热菌蛋白酶：R2=Leu、Ile、Phe、Tyr、 Val、Trp、Met 等
溴化氰法:R1= Met (化学方法)
胰蛋白酶（胰梅）：R1= Lye&Arg
糜蛋白酶（胰凝乳蛋白酶）：R1= Phe、
Trp&Tyr
小结
（2）常用测定方法简介
。
蛋白质一级结构的测定
Edman （苯异硫氰酸酯法）氨基酸顺序分析法实际上也是一种N-端分析法。此法的特点是能够不断重复循环，将肽链N-端氨基酸残基逐一进行解离。
Edman氨基酸顺序分析法
测定每条多肽链的氨基酸组成
蛋白质一级结构的测定
（2）常用测定方法简介
。
利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的交错重叠，拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。
蛋白质一级结构的测定
示例(十肽的水解)
A法水解得到四个小肽：
A1 Ala-Phe
A2 Gly-Lys-Asn-Tyr
A3 Arg-Tyr
A4 His-Val
B法水解得到四个小肽：
B1 Ala-Phe-Gly-Lys
B2 Asn-Tyr-Arg
B3 Tyr- His-Val
（三）蛋白质的空间结构
1、概念
蛋白质的空间结构（或构象、高级结构）：指蛋白质分子中原子或基团在空间的排列分布和肽链的走向。包括二、(超二级结构、结构域）三、四级结构 。
构型（configuration）：指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向。两种构型间的转变需要共价键的断裂和重组。
COOH COOH
H2N C H H C NH2
R R
构象（conformation）:指取代原子或基团当单键旋转时可能形成的不同立体结构。这种空间位置的改变不涉及共价键的断裂。
概念
肽键平面或酰胺平面：由于肽键中C-N具有部分双键的性质，不能旋转，使得肽键中的四个原子和与之相邻的两个α-碳原子共处于一个平面，此平面就称为肽键平面或酰胺平面
概念
蛋白质的构象：蛋白质分子中所有原子在三维空间的排列分布和肽链的走向。一个蛋白质的多肽链在生物体正常的温度和pH条件下，只有一种或很少几种构象。这种天然构象保证了它的生物学活性，并且相当稳定。
概念
蛋白质的构象
蛋白质多肽链空间折叠的限制因素：Pauling和Corey在利用X-射线衍射技术研究多肽链结构时发现：
：

碳原子（C）都处于同一个平面内，此刚性结构的平面叫肽平面（peptide plane）或酰胺平面（amide plane）。
定义：蛋白质的二级(Secondary)结构又叫主链构象，是指多肽链的主链本身（主链骨架）在空间的排列、旋转及折叠，并以氢键维系，而形成的有规则的构象。
它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。二级结构不涉及氨基酸残基的侧链构象。氢键是稳定二级结构的主要作用力。
主要有-螺旋、-折叠、-转角、自由回转。
2、蛋白质的二级结构
⑴.-螺旋结构及其特点
螺旋构象：指多肽链骨架围绕螺旋中心轴一圈一圈地上升而形成的螺旋式的空间结