已经公布真菌基因组.doc

［转载]已经公布的真菌基因组　
摘要:真菌基因组学研究可以推动生物化学、分　子生物学、病原菌的致病机理、与宿主相互作用等基础研究,还能更好的寻找抗菌药物靶点，促进疫苗和抗菌药物的开发研制、促进工业生产。目前已有48种真菌 的基因组序列公布，包括子囊菌门(Asｃｏmｙcｏta）42种,担子菌门(Basiｄiomyｃｏta)５种，微孢子虫 （Micｒｏｓpｏridia)1种。基因组大小超过30倍,　Mｂ~。本文整理翻译了ＮＣBＩ上关于真菌基因组的信息，对已测序真菌的重要性和其基因组相关信息进行了简要。
 
真菌种类庞大而多样,据估计,全世界有真菌150万种, 分布极为广泛，它们存在于土壤、水、空气和生物体内外。真菌在自然界的碳素和氮素循环中起主要作用。真菌参与淀粉、纤维素、木质素等有机含碳化合物的分 解,生成ＣO2，，因此可以分解木材、纸张、棉布和其他自然界中含碳的复杂有　机物。真菌对蛋白质及其他含氮化合物的分解所释放的NH３，一部分可供植物和微生物吸收同化，一部分可转化为硝酸盐, 真菌在发酵工业、食品加工业、抗生素生产中具有重要作用;而某些真菌又具有严重的破坏作用，有的真菌是许多重要经济作物的病原菌,如玉米腥黑穗病、小麦锈 病、黄瓜黑腥病等；少数真菌是人类和动物的致病菌，如白色念珠菌等。因此合理利用有益真菌，消灭和预防有害真菌具有重要意义。
基因组信息可以加深人们对真菌遗传和生理多样性的认识。１997年,由欧洲、美国、加拿大和　日本共96个实验室的633位科学家通力协作下，第一个真核生物酿酒酵母（Sａccharomyceｓ cereuisiae )的基因组测序完成。2０0２年粟酒裂殖酵母（Schiｚoｓaccharomｙcｅs pombe）基因组测序完成，两年后第一个丝状真菌粗糙脉孢菌（Neurospora crａssa），在NCＢI上(）已公开发布了４７种真菌的基因组序列，包括子囊菌门(Ａscｏmyｃota）41种，担子菌门(Basidiomycota）５种，微孢子虫(Mｉcｒｏsporｉdia)1种；在dｏgaｎ（）　上公布了米曲霉（Aｓpergillus oryzａｅ）．5～8１．５Mb，包括重要的人类病原菌、植物病原菌、腐生菌和模式生物。本文整理翻译了NＣＢI 上关于真菌基因组的信息，本文对已测序真菌的重要性和其基因组相关信息进行了简要概述.
                                                       已经公布的真菌基因组概况　
OrｇａnisｍｓSubgｒouｐ               TaxIＤ Ｓｉze  Chｒ  Sｔatus  method 
Dｅptｈ Cenｔer　
Aｊelｌｏｍyces　ｃapｓulａtus ＮAｍ１            Pezizomｙcotiｎａ       
   Ascｏsｐhaｅrａ　apis ＵＳDA-ARSEＦ        Peziｚomycotinａ         ３9２6１3　２4MB   5   Asｓembly  　WＧＳ   ４X    BCM
Asperｇiｌｌus clavａｔuｓ NRＲL　1           　Ｐezizoｍycｏtｉna         34４6１2 35MＢ   5   Asｓembly   WGS    TIGR
Asｐergillus fｌavｕs NRRL3357           　Pｅziｚｏmｙcｏtina         ３３２95２ 36MB   ８   Aｓｓｅｍbly  　WGS  5X     TIGＲ　
　Ａsｐeｒｇｉlluｓ fumigatｕs　Af２93            Pezizomyｃotina         33087９　30MＢ   ８   Aｓseｍｂlｙ   WGS 　１０。5X  TIＧR
　　Asｐｅrgiｌlus　oryzae ＲＩＢ４0               Peziｚomyｃｏtina         5062   3７MB   8   Assembly   ＷGS 　—      ＡIST
Asｐergilｌｕs nidulans　FGSＣ A4         Ｐeｚizｏmycotｉnａ         2273２1 31MB   8   Asｓeｍblｙ   WGS  13X    BI