已经公布的真菌基因组.doc

[转载]已经公布的真菌基因组摘要:真菌基因组学研究可以推动生物化学、分子生物学、病原菌的致病机理、与宿主相互作用等基础研究,还能更好的寻找抗菌药物靶点,促进疫苗和抗菌药物的开发研制、促进工业生产。目前已有48种真菌的基因组序列公布,包括子囊菌门(ycota)42种,担子菌门(Basidiomycota)5种,微孢子虫(Microsporidia)1种。基因组大小超过30倍,~。本文整理翻译了NCBI上关于真菌基因组的信息,对已测序真菌的重要性和其基因组相关信息进行了简要. 真菌种类庞大而多样,据估计,全世界有真菌150万种,已被描述的约7万种。真菌在自然界中分布极为广泛,它们存在于土壤、水、空气和生物体内外。真菌在自然界的碳素和氮素循环中起主要作用。真菌参与淀粉、纤维素、木质素等有机含碳化合物的分解,生成CO2,为植物提供碳源。比如许多担子菌能够利用纤维素和木质素作为生长的碳源和氮源,因此可以分解木材、纸张、棉布和其他自然界中含碳的复杂有机物。真菌对蛋白质及其他含氮化合物的分解所释放的NH3,一部分可供植物和微生物吸收同化,一部分可转化为硝酸盐,成为氮素循环中不可替代的一步。某些真菌在发酵工业、食品加工业、抗生素生产中具有重要作用;而某些真菌又具有严重的破坏作用,有的真菌是许多重要经济作物的病原菌,如玉米腥黑穗病、小麦锈病、黄瓜黑腥病等;少数真菌是人类和动物的致病菌,如白色念珠菌等。因此合理利用有益真菌,消灭和预防有害真菌具有重要意义。基因组信息可以加深人们对真菌遗传和生理多样性的认识。1997年,由欧洲、美国、加拿大和日本共96个实验室的633位科学家通力协作下,第一个真核生物酿酒酵母(haromycescereuisiae)的基因组测序完成。2002年粟酒裂殖酵母(haromycespombe)基因组测序完成,两年后第一个丝状真菌粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa)基因组测序完成。截至目前,在NCBI上(.gov/sutils/=fungi)已公开发布了47种真菌的基因组序列,包括子囊菌门(ycota)41种,担子菌门(Basidiomycota)5种,微孢子虫(Microsporidia)1种;在dogan()上公布了米曲霉(Aspergillusoryzae)的基因组序列。~,包括重要的人类病原菌、植物病原菌、腐生菌和模式生物。本文整理翻译了NCBI上关于真菌基因组的信息,本文对已测序真菌的重要性和其基因组相关信息进行了简要概述。                                                      anismsSubgroup              TaxIDSize Chr Status method DepthCenter AjellomycescapsulatusNAm1           Pezizomycotina           AscosphaeraapisUSDA-ARSEF        Pezizomycotina        24MB  5  Assembly  WGS  4X    BCM AspergillusclavatusNRRL1           Pezizomycotina        35MB  5  Assembly  WGS  TIGR AspergillusflavusNRRL3357           Pezizomycotina        36MB  8  Assembly  WGS 5X    TIGR AspergillusfumigatusAf293           Pezizomycotina        30MB  8  Assembly  WGS  TIGR AspergillusoryzaeRIB40              Pezizomycotina        5062  37MB  8  Assembly  WGS -     AIST AspergillusnidulansFGSCA4         Pezizomycotina        31MB  8  Assembly  WGS 13X   BI AspergillusterreusNIH2624           Pezizomycotina        35MB  8  Assembly  WGS           Pezizomycotina        38MB  30  As