生物化学——
研究生命的化
学本质
物质基础
生命活动
(代谢)
功 能
有机小分子、无机离子
生物大分子(多糖、脂、
核酸、蛋白
酶 )
组成——元素组成、结构组成
分布——胞内、胞外
结构——一级(化学)结构
高级(空间)结构
性质——一般化学性质、光学性质
物理化学性质
生物学活性(变性、复性)
物质代谢
(同化、异化)
能量代谢
代谢途径(分解、合成)——物质能量衍替
代谢调控(限速酶)
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2
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核 酸(5'→3 ' )
磷酸
碱基(Py/Pu)
(2'-脱氧)核糖
(稀有)
核苷
A/G/C/T(U)
核苷酸
核酸(A\B\Z型)
DNA
3',5'-磷酸二酯键
甲酸盐、 CO2
Gly、 Gln
Asp、Ser
氨甲酰磷酸
复制
逆转录(逆转录酶)
不对称转录(RNA聚合酶)
自我复制
(RNA复制酶)
半不连续复制
半保留复制
DNA聚合酶
原:ⅠⅡⅢⅣⅤ
真:αεθ(核心)
PRPP
原:α2ββ‘ω(核心)σ
真:ⅢⅠ Ⅱ
胞质溶胶
细胞核/细胞器
RNA(mRNA
rRNA
tRNA)
碱基分解在三个水平上
核苷酸转化在不同磷酸水平上
核
酸
酶
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核酸
DNA
mRNA
tRNA
rRNA
组成
dNTP(A G C T)
NTP(A G C U)
分布(主)
细胞核(类核、叶绿体、线粒体、病毒)
细胞质为主(核糖体)、细胞核次(病毒)
化学结构
3,5磷酸二酯键连接而成的核苷酸链(5→3)
5-帽子、3-polyA
DHU Ψ
5S、 16S、23S(原核) 5S、、18S、28S
二级结构
双螺旋(B\A\Z)
局部螺旋+突环
三叶草型
局部螺旋+突环
三级结构
超螺旋
超螺旋
倒L型
超螺旋
超分子复合物
染色体(病毒)
核糖体(病毒)
化学性质
白色纤维状固体
白色粉末,水溶,有机醇沉淀
光学性质
OD260 (dsDNA>ssDNA>RNA>poly(d)NTP
变性复性
增色效应、减色效应、Tm(热变性)、分子杂交
电化学
电泳(p-)
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核苷酸代谢
从
头
合
成
补救途径
Ser:环外CH3
Gln:环外NH2
PRPP
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6
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7
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原核生物(大肠杆菌)
真核生物
复制
DNA聚合酶 I II III
染色体环形,单点双向复制
一次复制完成前可起始下一次
无特殊的末端复制
DNA聚合酶全酶
染色体线形,多点双向复制
不能同时多次起始复制
组装核小体
端粒复制
转录
转录和翻译几乎同步
RNA聚合酶α2ββ'σ
启动子(-35区和-10区)
转录后加工较简单(切、加、修饰)
调控简单,负调控为主
区域化分开
RNA聚合酶 I II III
启动子(-75区和-25区)
转录后加工复杂(切、接、加、修饰)
调控复杂,正调控为主
翻译
核糖体较小而简单(30S+50S=70S)
起始氨基酸fMet
多顺反子
SD序列(翻译起始)
起始因子较少,延伸和终止因子较多
核糖体大而复杂(40S+60S=80S)
起始氨基酸Met
单顺反子
5'-帽子结构
起始因子多,延伸和终止因子少
线粒体和叶绿体合成类似原核生物
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蛋白质
化学组成
C H O N (16%) P S
结构组成
氨基酸(蛋白质氨基酸)
化学结构
肽键连接而成的氨基酸链(N→C)
二级结构
α-螺旋 β-转角 β -折叠 无轨卷曲(链内/间氢键)
超二级结构
结构域
三级结构
亚基、单体蛋白(侧链基团次级键)
四级结构
寡聚蛋白(如别构酶)
化学性质
两性解
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