基础生物化学 复习总结.pptx

生物化学——研究生命的化学本质物质基础生命活动(代谢)功能有机小分子、无机离子生物大分子(多糖、脂、核酸、蛋白酶)组成——元素组成、结构组成分布——胞内、胞外结构——一级(化学)结构高级(空间)结构性质——一般化学性质、光学性质物理化学性质生物学活性(变性、复性)物质代谢(同化、异化)能量代谢代谢途径(分解、合成)——物质能量衍替代谢调控(限速酶)核酸(5'→3')磷酸碱基(Py/Pu)(2'-脱氧)核糖(稀有)核苷A/G/C/T(U)核苷酸核酸(A\B\Z型)DNA3',5'-磷酸二酯键甲酸盐、CO2Gly、GlnAsp、Ser氨甲酰磷酸复制逆转录(逆转录酶)不对称转录(RNA聚合酶)自我复制(RNA复制酶)半不连续复制半保留复制DNA聚合酶原:ⅠⅡⅢⅣⅤ真:αεθ(核心)PRPP原:α2ββ‘ω(核心)σ真:ⅢⅠⅡ胞质溶胶细胞核/细胞器RNA(mRNArRNAtRNA)碱基分解在三个水平上核苷酸转化在不同磷酸水平上核酸酶核酸DNAmRNAtRNArRNA组成dNTP(AGCT)NTP(AGCU)分布(主)细胞核(类核、叶绿体、线粒体、病毒)细胞质为主(核糖体)、细胞核次(病毒)化学结构3,5磷酸二酯键连接而成的核苷酸链(5→3)5-帽子、3-polyADHUΨ5S、16S、23S(原核)5S、、18S、28S二级结构双螺旋(B\A\Z)局部螺旋+突环三叶草型局部螺旋+突环三级结构超螺旋超螺旋倒L型超螺旋超分子复合物染色体(病毒)核糖体(病毒)化学性质白色纤维状固体白色粉末,水溶,有机醇沉淀光学性质OD260(dsDNA>ssDNA>RNA>poly(d)NTP变性复性增色效应、减色效应、Tm(热变性)、分子杂交电化学电泳(p-)核苷酸代谢从头合成补救途径Ser:环外CH3Gln:环外NH2PRPP原核生物(大肠杆菌)真核生物复制DNA聚合酶IIIIII染色体环形,单点双向复制一次复制完成前可起始下一次无特殊的末端复制DNA聚合酶全酶染色体线形,多点双向复制不能同时多次起始复制组装核小体端粒复制转录转录和翻译几乎同步RNA聚合酶α2ββ'σ启动子(-35区和-10区)转录后加工较简单(切、加、修饰)调控简单,负调控为主区域化分开RNA聚合酶IIIIII启动子(-75区和-25区)转录后加工复杂(切、接、加、修饰)调控复杂,正调控为主翻译核糖体较小而简单(30S+50S=70S)起始氨基酸fMet多顺反子SD序列(翻译起始)起始因子较少,延伸和终止因子较多核糖体大而复杂(40S+60S=80S)起始氨基酸Met单顺反子5'-帽子结构起始因子多,延伸和终止因子少线粒体和叶绿体合成类似原核生物蛋白质化学组成CHON(16%)PS结构组成氨基酸(蛋白质氨基酸)化学结构肽键连接而成的氨基酸链(N→C)二级结构α-螺旋β-转角β-折叠无轨卷曲(链内/间氢键)超二级结构结构域三级结构亚基、单体蛋白(侧链基团次级键)四级结构寡聚蛋白(如别构酶)化学性质两性解离(等电点、等离子点)光学性质OD280(Trp、Tyr、Phe)物理化学胶体(水化层、电荷作用)显色反应茚三酮反应双缩脲反应Sanger反应Edaman反应沉淀反应破坏水化层(盐析、脱水剂)、电中和(盐析、重盐、生物碱)变性复性变性——次级键破坏,肽键正常电化学变性电泳(pH—pI)、变性电泳(SDS)测序肽链数确定—肽链分离—末端测定—专一裂解—片段纯化测序—末端重叠蛋白(N→C)氨基酸多肽链氨基酸、核糖体、mRNA、tRNA、辅助因子(Mg2+、IF、EF、RF)氨基酸活化终止和释放延伸合成起始翻译后加工运输蛋白NH3氨同化转氨基作用氨基酸转化[Glu氨甲酰磷酸]生物固氮NO3还原含N有机物分解合成氨基酸铵盐酰胺尿素酮酸氧化分解、生成氨基酸或糖和脂氨基酸脱氨、糖分解、植物光呼吸Pyr——Ala族乙醛酸、PGA——Ser族草酰乙酸/延胡索酸——Asp族α-酮戊二酸——Glu族Ru5P——HisE4p、PEP——芳香族氨基酸/肽段切除特征序列添加共价修饰折叠[一碳转移]脱氨基(氧化\转氨\联合\非氧化\脱酰胺)胺(羟化/直接)脱羧基