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酶动力参数Km、Vmax和Kcat值的计算(共3页).doc


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酶动力参数Km、Vmax和Kcat值的计算有保存米氏函数,但是Hill函数与米氏函数类似(如下)(“Origin Basic Functions”函数下的Hyperbl也是类似与米氏函数的可选函数),当n=1是就完全变成了米氏函数,所以接着在左边的“Parameters”中将n=1的可选框构上,点击“Fit”进行拟合,Km、Vmax值等拟合的数据就在弹出的窗口中显示出来了,注意这里的Vmax值不是本文所指的Vmax值,两者的意义和单位都不一样,发表用的Vmax单位通常为nkat×mg-1 protein(见下文),而此处的Vmax为输入数据时的Y轴值,如果数据由日立U3010分光光度计测得,则其代表“活度”,即每分钟内吸光度变化的量。
Xn
Hill函数: Y=Vmax
Kn+ Xn
Vmax
Vmax表示在一定酶量下的最大反应速率,即酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓
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度呈正比。通常发表论文的Vmax单位为nkat×mg-1 protein,表示每毫克纯化的蛋白有多少个nkat活力。这里有必要弄清楚酶活力单位的意义,国际上有两种活力单位:IU和Kat,它们的意义分别为:
1IU:指在特定条件(25℃,其它为最适条件)下,在1分钟内能转化1微摩尔底物的酶量,或是转化底物中1微摩尔的有关基团的酶量。
1Kat:在最适条件下,1秒钟能使1摩尔底物转化的酶量。
Kat和IU的换算关系:1 Kat=6×107IU, 1IU= Kat
日立U3010测得的酶活力是用“活度”表示的,即每分钟内吸光度变化的量。所以要将活度换算为Kat,首先必须将吸光度的变化与底物的变化联系起来。这里的底物是指具有特定波长的光吸收,用来指示酶反应进程的物种,如氧化还原酶通常选择NADH/NADPH。这里以托品酮还原酶TRI为例,测定340nm处NADPH的活度值。首先吸光度Abs与底物浓度c是有公式联系的:
Abs=c·ε·l
在实际测定中,“ε·l”部分可以作为一个常数处理,在一个反应体系中将NADPH的浓度固定,测出吸光度A值后即可换算出“ε·l”值,通常选3个浓度,取三个“ε·l”的品均值。如TRI的酶活测定中:
200 uM·ε·l= → ε·l=
100 uM·ε·l= → ε·l= 平均ε·l=
由于活度的意义是1min内吸光度的变化量,则选取一个线性比较好的酶反应的动态吸光度曲线,记录下它0s和60s两个点的吸光度值,用上面得到的ε·l值算出各自的底物

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  • 上传人rdwiirh
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  • 时间2022-04-17