蛋白质空间结构
( 3 )R侧链基团伸向螺旋的外侧。
R
R
R
R
R
R
R
R
R
螺旋的横截面
( 4 )绝大多数为右手螺旋。
因为左手螺旋中R基团的空间位阻大,
态构象层次。
又标准折叠单位、折叠花式
常见组合:
αα βαβ ββ
第二节 超二级结构和结构域
二、结构域(熟悉)
结构域是球状蛋白质的结构或功能单位。
多肽链在二级或超二级结构的基础上进一步绕曲折叠成紧密的近似球形的结构, 具有部分生物功能。
对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个以上结构域缔合而成三级结构。
一、蛋白质的三级结构(掌握)
指多肽链上的所有原子(包括主链和侧链)在三维空间的分布。
指多肽链在二级或超二级结构的基础上折叠而成的构象。
维持力(稳定因素)
次级键,以疏水作用为主
球状蛋白质的分类
据结构域类型分四类
全α结构蛋白质
αβ结构蛋白质
全β结构蛋白质
富含金属或二硫键蛋白质
第三节 三级结构与四级结构
二、球状蛋白质三维结构的特征(重点)
(1)分子含多种二级结构单元
(2)构象有明显的折叠层次
二级→超二级→结构域→三级→四级
(3)分子是紧密的球状或椭球状实体
(4)疏水R在内,亲水R在表面
(5)分子表面有一个空穴(裂缝、凹槽、口袋)
三、四级结构(重点、难点)
以三级结构球体为单位缔合形成的构象。
具有四级结构的蛋白质称为寡聚蛋白。
寡聚蛋白中的每个独立球体称为亚基(单体)。
由两(四)个亚基组成的蛋白质称为二(四)聚体蛋白。
由相(不)同亚基组成的寡聚蛋白质称为同(杂)多聚蛋白质。
杂多聚蛋白质中亚基可分为对称的两组时,每组叫原体或原聚体。
四级结构缔合驱动力(稳定因素)
同三级结构
单体蛋白
寡聚蛋白
分子
亚基(单体)
亚基(单体)
分子
分子
多分子聚集体
同多聚蛋白质
杂多聚蛋白质
原(聚)体
四、四级缔合在结构和功能上的优越性(了解)
1、增强结构稳定性
2、提高遗传经济性和效率
3、使催化基团汇集在一起
4、具有协同性和别构效应
别构效应
结合在蛋白质分子特定部位的配体对该分子其它部位产生的影响。
协同性
结合在蛋白质分子特定部位的配体对其它各部位产生的影响一致。
别构蛋白质 具有别构效应的蛋白质。
别构效应据配体接合部位分:
同促效应 异促效应
同促效应
◎
※
异促效应
◎
□
#
※与◎结合后,影响其它亚基◎与※的亲和力
#与□结合后,影响其它亚基◎与※的亲和力
◎结合部位 ※底物
□调节部位 #效应物
构象与结构层次
蛋白质是具有特定天然空间结构的大分子,其空间结构称为蛋白质的构象。
分为若干层次:
一级(1°)结构 ()
二级(2°)结构 ()
()蛋白最高级
三级(3°)结构 ()
()蛋白最高级
四级(4°)结构 ()
()蛋白特有
共价键
次级键
化学键
肽键
()级结构
氢键
二硫键
()级结构
疏水键
盐键
范德华力
()级结构
蛋白质分子中的共价键与次级键
第四节 结构与功能的关系
一、一级结构与功能的关系(重点)
一级→构象→性质→功能
一级结构决定蛋白质的空间结构。
多肽链中氨基酸的排列顺序决定了该肽链的折叠、盘曲方式。
主要表现在
1、同种蛋白质不能有差错
2、同源蛋白质有较大的同序性
3、蛋白原不具活性,但改变一级结构后可被激活
4、蛋白质共价修饰导致活性改变
分子病
种属差异
连接二※
镰状细胞贫血(sick-cell anemia)
从患者红细胞中鉴定出特异的镰刀型或月牙型细胞。
β-链 1 2 3 4 5 6 7
Hb-A Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Lys…
Hb-S Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Lys…
Val 取代Glu
含氧-HbA
O2
O2
粘性疏水斑点
含氧HbS
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