MEGA 软件——系统发育树构建方法(图文讲解) 201 2年12月02日?Evolution ?字号小中大?评论 3条?阅读 3,872 次[点击加入在线收藏夹] 一、序列文本的准备构树之前先将目标基因序列都分别保存为 txt 文本文件中(或者把所有序列保存在同一个 txt 文本中,可以用“>基因名称”作为第一行,然后重起一行编辑基因序列), 序列只包含序列字母( ATCG 或氨基酸简写字母)。文件名名称可以已经您的想法随意编辑。二、序列导入到 Mega 5软件(1)打开 Mega 5软件,界面如下(2)导入需要构建系统发育树的目的序列 OK选择分析序列类型(如果是 DNA 序列,点击 DNA ,如果是蛋白序列,点击 Protein ) 出现新的对话框,创建新的数据文件选择序列类型导入序列导入序列成功。(3)序列比对分析点击工具栏中“W”工具,进行比对分析,比对结束后删除两端不能够完全对齐碱基(4)系统发育分析关闭窗口,选择保存文件路径,自定义文件名称三、系统发育树构建根据不同分析目的,选择相应的分析算法,本例子以 N—J算法为例 Bootstrap 选择 1000 ,pute ,开始计算计算完毕后,生成系统发育树。
MEGA5使用说明 来自淘豆网m.daumloan.com转载请标明出处.
