SELDI技术联合MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性的研究报告.pdf

山西医科大学
硕士学位论文
SELDI技术联合MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性
的研究报告
姓名:吉利娜
申请学位级别:硕士
专业:肿瘤学
指导教师:裴毅
2011-03-15
山西医科大学硕士学位论文
SELDI 技术联合 MATLAB 软件预测 FOLFOX4 方案治疗大肠癌敏感性
的研究报告
研究生:吉利娜专业:肿瘤学导师:裴毅
中文摘要
目的:探索用 SELDI 技术联合 MATLAB 软件预测和判断 FOLFOX4 方案治疗大肠癌疗效的可
行性。
方法:留取 FOLFOX4 方案化疗前 60 名有可观察指标的大肠癌患者(男性38 例、女性22 例)
血清,行 SELDI-TOF-MS 技术(surface-enhanced laser desorption / ionization time of flight mass
spectrometry 表面增强激光解析离子飞行时间质谱技术)检查,描绘其指纹图谱为分析用。第一阶
段工作:12 名大肠癌患者入组,FOLFOX4 方案治疗后根据实体瘤疗效评价标准将这些患者
分成:稳定组(SD)、无效组(PD),采用 ProteinChip 软件和 Biomarker Wizard
软件分析两组间的差异蛋白质指纹。用 MATLAB 软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指
纹的拟合曲线及曲线方程,修正界定指纹;第二阶段工作:48 名准备接受 FOLFOX4 方案化
疗的大肠癌患者入组,接受三个周期的 FOLFOX4 方案化疗后,将化疗前的指纹根据第一阶
段预测疗效界定标准将患者分成符合指纹人群和不符合指纹人群,分析按实体瘤疗效评价
标准分成的 SD 和 PD 组患者指纹中相同质/核比(M/Z)的蛋白质含量(丰度)与实际疗效的相
关性,并界定能反映疗效的指纹丰度。
结果:(1)有 3 个差异蛋白质峰(M/Z为 2868、1204、4176)在稳定组和无效组中有统计学意
义(p<),基线漂移(drift)±50H+。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异
指纹的曲线且曲线方程均呈线性的函数关系。因此,M/Z: 2868±50H+丰度下调,M/Z:
1204±50H+、4176±50H+丰度上调与疗效提高呈正相关,反之亦然。(2) 以M/Z:2868±50H+
丰度<10 归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为 %,无效组中指纹符
合率为 %;以M/Z:1204±50H+丰度>10 归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹
符合率为 %,无效组中指纹符合率为 81%;以M/Z:4176±50H+丰度>40 归为稳定组,
反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为 %,无效组中指纹符合率为 81%。
结论:借助于蛋白质指纹技术及MATLAB软件预测FOLFOX4 方案治疗大肠癌的耐药是可
行的。经SELDI检查,其指纹图谱M/Z:2868±50H+、1204±50H+、4176±50H+为预测FOLFOX4
方案治疗大肠癌敏感性的指纹标识,其M/Z:2868±50H+丰度<10、1204±50H+丰度>10、
4176±50H+丰度>40 为预测FOLFOX4 方案治疗大肠癌可获得稳定的标识指纹;其M/Z:
2868±50H+丰度≥10、1204±50H+丰度≤10、4176±50H+丰度≤40 为预测FOLFOX4 方案治疗
大肠癌无效的标识指纹。
关键词:SELDI;MATLAB 软件;FOLFOX4 方案;大肠癌



II
山西医科大学硕士学位论文
Evaluation of SELDI technology and MATLAB software to identify
Colorectal cancer patients with tumor response to FOLFOX4
Abstract
Object: To exploring the feasibility of identifying Colorectal cancer patients with tumor
response to FOLFOX4 by SELDI technology and MATLAB software.
Methods: Collected 60 serums of Colorectal cancer patients(38 males, 22females) who had
observable indexs, performed SELDI