第九课电泳图谱的图像分析.ppt

电泳图谱的图像分析
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回顾
Functional analysis
State 1
State 2
2DE
PMF
MS/MS
LC-MS/MS
Database search
Differential analysis
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电泳图谱的图像分析简介what can we get from image analysis?
双向凝胶电泳技术是目前蛋白质组研究的主要技术之一, 双向电泳根据等电点和分子量可一次性分离数千种蛋白质,经染色后蛋白质再PAGE上可形成密度不同、分布不均的复杂点图谱。
如何有效的对双向凝胶电泳图像分析,如何对图谱上的蛋白质点进行检测、定量、比较、分析和归类,挖掘有价值的蛋白质点的信息是双向电泳分析软件所要解决的问题。
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PDQuest 软件简介
PDQuest软件是显示(imaging)、分析(analyzing)双向电泳图谱&数据库查询的一个软件包
硬件:一定的电脑配置,Pentirm 166处理器,64M内存,3G硬盘,1024*768分辨率,256色,SCI接口,windows操作系统
软件: PDQuest双向凝胶图像分析软件,Bio-Rad Laboratory,Hercules,CA
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PDQuest 软件的使用
以PDQUEST 2-D分析软件为例将双向电泳分析的基本实验过程做一简单介绍。
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凝胶的图像处理分析及细胞蛋白谱的建立
典型流程
凝胶图像的扫描:
图像加工:
斑点检测和定量:
凝胶配比:
数据分析:
数据呈递(report)
2-DE数据库的建立:
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PDQuest 软件
PDQUEST 2-D分析软件系统和其他2-D分析软件系统一样,包括:
一图象采集与加工:
二斑点检测
三斑点匹配
四数据分析及输出
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PDQuest 软件的使用
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一、图象采集与加工(editing images)
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