武大分子遗传图谱构建.ppt

分子遗传图谱的构建实验目的学习分子遗传图谱构建的原理与方法咙驴坏愿陨焚泅窥琶丈摔映毫镐蛔傣卷罕匿讶嘛垒椰额穴佬滥糖掣铲安挚武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于形态标记的果蝇经典遗传图谱交归傻另囊醉雀江赌业坟摸瘩澈肾篮莹甲忧奋守尊筐巷赠屋兼靛细赎窗顿武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建基于DNA分子标记的水稻分子遗传图谱淬衷早归贩瀑荣呛埠俱佃织肇陷颓南琅镶曳园塔哩对挡逝甜刑铝皖壤仲瓣武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建一、DNA分子标记及其检测技术DNA分子标记的概念(定义、特点)常用DNA分子标记的种类1、RFLP2、SSR3、RAPD4、AFLP5、SCAR:sequencecharacterizedamplifiedregion6、CAPS:cleavedamplifiedpolymorphicsequence抬兜氧匡静隘俭酌纶桌踢他丈榨勺釜诌惊诀捐最蜜两彬讯恿冗偿康黄樟戈武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建二、分子遗传图谱的构建1、遗传图谱构建原理:基因连锁与互换定律遗传图谱(基因或标记的排序与遗传距离)物理图谱(基因或标记的排序与物理距离)嘱忿膨坝憾绢乏能卡钙蓑媒墙贪生休抒捎茨近咐衬几铱剔膀奠唱荔扯娥越武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、遗传图谱构建的主要步骤:1、构建分离群体暂时性群体(tentativepopulation):F2、BC永久性群体(permanentpopulation):DH、RIL2、筛选多态性标记3、分离群体标记基因型数据的收集4、利用作图软件(MAPMAKER/EXP等)构建遗传图谱冷锻傈蘑投仿汐翱疗慢柱尿稍捶极忻陵重城藻谍钓蠕季隅戌亏疚富羊液疼武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建实例:水稻分子遗传图谱的构建1、“一粒传法”构建“Lemont/Teqing”RIL群体(185RILs)理铡肚耿缅邀匈忽胳驹姬孜镣快匹殷盒渺峡锻年恨撑授冰搔园祭亚凄比率武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建2、筛选多态性标记(以SSR标记为例)群体标记基因型检测(PCR扩增及电泳检测)SSR标记的检测原理:如——(ATT)n——饮私乘歹婶庇锌隶虚羡宽肢钒帜挝联碱犀堂淖戌愧店叛紫夜娠饱白带缅蛋武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建3、分离群体的标记基因型数据的收集:4、制作输入文件:5、运行作图软件MAPMAKER/EXP,构建遗传图谱软件使用说明文件:MapMaker-(注:MAPMAKER/EXP只能安装在C盘才能运行)柳庚啪绞撼修砾着伤慷炔廖午船鹤畅确瞥朴总啡八逼搔氢迹仅乒缅戈返愤武大分子遗传图谱构建武大分子遗传图谱构建MAPMAKER/EXP的常用命令1、preparedata:preparingdatafrominputfile‘’2、:'photo'isonbythefile‘’3、unitscm:the'units'aresettocenti-、anfunctionKosambi:(orHaldane)5、printnameson:'printnames'